More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03222 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  100 
 
 
901 aa  1842    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  99.78 
 
 
901 aa  1837    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  74.39 
 
 
903 aa  1399    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  91.34 
 
 
901 aa  1644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  47.01 
 
 
902 aa  846    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  99.78 
 
 
901 aa  1837    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  75.75 
 
 
904 aa  1442    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  99.45 
 
 
901 aa  1830    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  99.67 
 
 
901 aa  1836    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  99.56 
 
 
901 aa  1833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  91.34 
 
 
901 aa  1644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  74.39 
 
 
903 aa  1399    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  91.34 
 
 
901 aa  1644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  88.57 
 
 
901 aa  1604    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  46.78 
 
 
902 aa  850    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  100 
 
 
901 aa  1842    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  91.24 
 
 
902 aa  1640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  99.33 
 
 
901 aa  1827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  91.23 
 
 
901 aa  1643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  46 
 
 
901 aa  810    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  48.45 
 
 
921 aa  860    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  37.11 
 
 
914 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.87 
 
 
1021 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.02 
 
 
887 aa  275  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27 
 
 
916 aa  266  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.42 
 
 
1019 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.6 
 
 
913 aa  226  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.83 
 
 
876 aa  225  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.86 
 
 
1003 aa  222  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
904 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.76 
 
 
917 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  26.55 
 
 
947 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.78 
 
 
901 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.12 
 
 
914 aa  207  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.15 
 
 
911 aa  205  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.08 
 
 
880 aa  201  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  30.89 
 
 
900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.35 
 
 
870 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.34 
 
 
867 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
921 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  25.94 
 
 
914 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.4 
 
 
897 aa  187  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.42 
 
 
922 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.64 
 
 
930 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.11 
 
 
921 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.11 
 
 
921 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.11 
 
 
921 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  25.94 
 
 
878 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.75 
 
 
910 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 
913 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
914 aa  178  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  25.26 
 
 
920 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  25.82 
 
 
824 aa  172  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.64 
 
 
889 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  29.02 
 
 
899 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  28.61 
 
 
896 aa  169  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  28.83 
 
 
913 aa  168  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  26.35 
 
 
906 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.87 
 
 
905 aa  167  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.34 
 
 
896 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.84 
 
 
894 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.28 
 
 
933 aa  164  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.41 
 
 
900 aa  164  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.23 
 
 
860 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  25.49 
 
 
921 aa  161  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.36 
 
 
904 aa  161  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 
906 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.9 
 
 
905 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  29.29 
 
 
1110 aa  158  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.94 
 
 
905 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.31 
 
 
924 aa  157  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.84 
 
 
896 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.54 
 
 
766 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  31.28 
 
 
911 aa  152  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  25.86 
 
 
905 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  31.28 
 
 
900 aa  151  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
905 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.47 
 
 
884 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  23.91 
 
 
894 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  25.97 
 
 
907 aa  149  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.73 
 
 
907 aa  147  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.07 
 
 
758 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  25.78 
 
 
907 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.58 
 
 
901 aa  144  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.8 
 
 
749 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
947 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  25.56 
 
 
907 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  26.92 
 
 
1097 aa  140  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.03 
 
 
924 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  28.67 
 
 
717 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  26.73 
 
 
732 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.82 
 
 
730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.59 
 
 
846 aa  129  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 
901 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.58 
 
 
953 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  27.47 
 
 
1000 aa  124  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.17 
 
 
914 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.99 
 
 
947 aa  121  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.29 
 
 
1204 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.21 
 
 
919 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>