More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4759 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
913 aa  1823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  57.44 
 
 
914 aa  974    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  57.43 
 
 
913 aa  987    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  39.11 
 
 
947 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.23 
 
 
930 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.32 
 
 
924 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
904 aa  439  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.59 
 
 
932 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.49 
 
 
896 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.15 
 
 
933 aa  302  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.47 
 
 
913 aa  287  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
921 aa  287  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.66 
 
 
876 aa  280  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.51 
 
 
1003 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.51 
 
 
905 aa  274  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.84 
 
 
867 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  25.55 
 
 
887 aa  265  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.43 
 
 
901 aa  265  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  27.83 
 
 
921 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.03 
 
 
914 aa  254  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.76 
 
 
897 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  27.82 
 
 
900 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.67 
 
 
894 aa  251  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.32 
 
 
922 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  28.29 
 
 
907 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.06 
 
 
921 aa  244  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.06 
 
 
921 aa  244  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.95 
 
 
921 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.14 
 
 
910 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.75 
 
 
880 aa  240  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  26.29 
 
 
916 aa  240  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.1 
 
 
878 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 
907 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.72 
 
 
904 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.04 
 
 
924 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.57 
 
 
889 aa  231  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  29.68 
 
 
824 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.24 
 
 
877 aa  225  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.53 
 
 
917 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.31 
 
 
870 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  27.09 
 
 
901 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.99 
 
 
900 aa  199  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  28.98 
 
 
907 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.8 
 
 
914 aa  197  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  32.05 
 
 
896 aa  192  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  30.39 
 
 
901 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  28.6 
 
 
902 aa  184  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
902 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  28.34 
 
 
902 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.8 
 
 
925 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  30.18 
 
 
921 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.27 
 
 
766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  29.59 
 
 
901 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  36.71 
 
 
911 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.33 
 
 
930 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  173  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.16 
 
 
901 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  30.16 
 
 
901 aa  172  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.52 
 
 
749 aa  172  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.99 
 
 
758 aa  172  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  30.16 
 
 
901 aa  172  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  27.94 
 
 
1110 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  29.3 
 
 
903 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  29.3 
 
 
903 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.43 
 
 
901 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.44 
 
 
935 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.42 
 
 
1019 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.82 
 
 
846 aa  164  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.35 
 
 
914 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.72 
 
 
904 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  26.42 
 
 
944 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  30.34 
 
 
899 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  26.92 
 
 
919 aa  157  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5436  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.84 
 
 
891 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170631  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  28.15 
 
 
901 aa  157  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  28.95 
 
 
920 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.32 
 
 
897 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.32 
 
 
955 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  35.71 
 
 
919 aa  156  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  28.83 
 
 
914 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  27.99 
 
 
910 aa  154  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.93 
 
 
905 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  24.97 
 
 
947 aa  153  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  30.14 
 
 
1097 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.7 
 
 
905 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.01 
 
 
900 aa  150  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.45 
 
 
884 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
905 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.58 
 
 
928 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.63 
 
 
947 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  29.47 
 
 
905 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.86 
 
 
906 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 
906 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>