More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6753 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
932 aa  1863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.87 
 
 
930 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 
904 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.6 
 
 
924 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  41.78 
 
 
947 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  35.59 
 
 
913 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  36.22 
 
 
913 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
914 aa  416  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.29 
 
 
896 aa  290  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.29 
 
 
876 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.33 
 
 
905 aa  279  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.87 
 
 
913 aa  277  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.46 
 
 
901 aa  276  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.48 
 
 
867 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.32 
 
 
889 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.43 
 
 
910 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
921 aa  249  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.65 
 
 
914 aa  248  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.77 
 
 
1019 aa  247  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  27.48 
 
 
900 aa  229  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.2 
 
 
880 aa  229  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.37 
 
 
922 aa  227  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.68 
 
 
887 aa  224  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.17 
 
 
900 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.65 
 
 
1003 aa  220  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  28.12 
 
 
907 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  27.7 
 
 
921 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 
878 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.72 
 
 
921 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.95 
 
 
894 aa  211  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.6 
 
 
933 aa  211  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.62 
 
 
921 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.62 
 
 
921 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.84 
 
 
901 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.81 
 
 
1021 aa  207  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.27 
 
 
877 aa  205  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 
824 aa  205  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  29.8 
 
 
907 aa  204  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 
907 aa  204  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.02 
 
 
903 aa  201  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.02 
 
 
903 aa  201  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  28.73 
 
 
914 aa  201  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.91 
 
 
902 aa  200  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.22 
 
 
897 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.61 
 
 
921 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.26 
 
 
870 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  25.83 
 
 
924 aa  197  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.19 
 
 
930 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.02 
 
 
902 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  30.33 
 
 
904 aa  191  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  30.73 
 
 
896 aa  191  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  25.05 
 
 
904 aa  190  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.4 
 
 
911 aa  189  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  28.07 
 
 
1110 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
947 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.45 
 
 
947 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  31.73 
 
 
914 aa  177  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 
906 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  25.84 
 
 
960 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
901 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  27.63 
 
 
919 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  23.66 
 
 
901 aa  171  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  23.66 
 
 
901 aa  171  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  23.66 
 
 
901 aa  171  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  23.66 
 
 
901 aa  170  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  23.66 
 
 
901 aa  170  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  23.66 
 
 
901 aa  170  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.3 
 
 
897 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.3 
 
 
955 aa  167  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  27.55 
 
 
944 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.82 
 
 
925 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29 
 
 
917 aa  160  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 
899 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.73 
 
 
901 aa  156  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.94 
 
 
905 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.46 
 
 
935 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  29.45 
 
 
920 aa  152  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 
910 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.7 
 
 
900 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  30.83 
 
 
888 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.86 
 
 
749 aa  148  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.06 
 
 
905 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  29.16 
 
 
1108 aa  147  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  26.67 
 
 
901 aa  147  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.77 
 
 
766 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.27 
 
 
901 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  26.27 
 
 
901 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  26.27 
 
 
902 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  26.27 
 
 
901 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  26.27 
 
 
901 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  27.63 
 
 
905 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  26.42 
 
 
906 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
905 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  26.32 
 
 
1336 aa  142  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.84 
 
 
884 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.42 
 
 
916 aa  137  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.97 
 
 
758 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 
911 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.22 
 
 
730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25.54 
 
 
1111 aa  131  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>