More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04848 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  46.78 
 
 		 901 aa  827    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  46.78 
 
 		 901 aa  827    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  95.12 
 
 		 902 aa  1776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  45.9 
 
 		 901 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  100 
 
 		 902 aa  1867    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  46.78 
 
 		 901 aa  827    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  48.67 
 
 		 903 aa  890    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  48.67 
 
 		 903 aa  890    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  46.78 
 
 		 901 aa  828    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  45.96 
 
 		 902 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  46.84 
 
 		 901 aa  825    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  49 
 
 		 904 aa  900    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  46.78 
 
 		 901 aa  827    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  58.93 
 
 		 901 aa  1085    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  46.84 
 
 		 901 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  46.78 
 
 		 901 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  45.9 
 
 		 901 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  45.9 
 
 		 901 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  46.78 
 
 		 901 aa  827    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  45.9 
 
 		 901 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  78.27 
 
 		 921 aa  1460    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  36.32 
 
 		 914 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.34 
 
 		 1021 aa  285  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.12 
 
 		 887 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 921 aa  243  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.54 
 
 		 910 aa  233  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.03 
 
 		 913 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.65 
 
 		 1003 aa  229  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.45 
 
 		 876 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.47 
 
 		 1019 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.94 
 
 		 922 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.22 
 
 		 880 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.68 
 
 		 901 aa  224  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.84 
 
 		 877 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 914 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.46 
 
 		 904 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.54 
 
 		 917 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  25.19 
 
 		 896 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.05 
 
 		 921 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.05 
 
 		 921 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  29.19 
 
 		 916 aa  194  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.05 
 
 		 921 aa  194  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.17 
 
 		 894 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.67 
 
 		 930 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.79 
 
 		 896 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.91 
 
 		 932 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  23.88 
 
 		 900 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  28.34 
 
 		 913 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.46 
 
 		 897 aa  181  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.66 
 
 		 924 aa  180  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.71 
 
 		 914 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 		 906 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.08 
 
 		 911 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  24.12 
 
 		 906 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 904 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  30.05 
 
 		 913 aa  177  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  30.59 
 
 		 878 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.58 
 
 		 924 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  30.27 
 
 		 1110 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25.68 
 
 		 900 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.84 
 
 		 889 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  30.17 
 
 		 824 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  27.11 
 
 		 899 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.45 
 
 		 905 aa  162  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.19 
 
 		 867 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.42 
 
 		 947 aa  157  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.65 
 
 		 860 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.32 
 
 		 896 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 907 aa  153  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 907 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.59 
 
 		 758 aa  152  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 901 aa  151  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  26.67 
 
 		 907 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  26.19 
 
 		 920 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.33 
 
 		 766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  27.84 
 
 		 911 aa  149  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.95 
 
 		 933 aa  149  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  25.05 
 
 		 914 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  25.83 
 
 		 1097 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  25.9 
 
 		 910 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.88 
 
 		 905 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.64 
 
 		 749 aa  144  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  30.08 
 
 		 900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  22.6 
 
 		 891 aa  141  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.89 
 
 		 730 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  25.06 
 
 		 732 aa  135  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  30.37 
 
 		 756 aa  135  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 905 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  23.45 
 
 		 905 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.03 
 
 		 905 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  26.28 
 
 		 960 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 947 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.49 
 
 		 907 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.79 
 
 		 884 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.25 
 
 		 901 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.57 
 
 		 914 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.09 
 
 		 846 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  28.35 
 
 		 919 aa  122  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.03 
 
 		 1061 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.12 
 
 		 947 aa  121  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>