More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3393 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  78.38 
 
 		 953 aa  1226    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 900 aa  1701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.22 
 
 		 907 aa  274  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.94 
 
 		 884 aa  247  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.34 
 
 		 1021 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.96 
 
 		 935 aa  221  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.03 
 
 		 877 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.33 
 
 		 880 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.37 
 
 		 846 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.71 
 
 		 917 aa  191  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.47 
 
 		 867 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  40.62 
 
 		 910 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.77 
 
 		 766 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.22 
 
 		 897 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.48 
 
 		 876 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  29.69 
 
 		 824 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  29.81 
 
 		 887 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  31.9 
 
 		 901 aa  168  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  31.37 
 
 		 901 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  31.37 
 
 		 901 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  31.37 
 
 		 901 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  31.37 
 
 		 902 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  31.37 
 
 		 901 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.79 
 
 		 914 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  31.28 
 
 		 901 aa  164  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  28.05 
 
 		 947 aa  163  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  31.28 
 
 		 901 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  31.28 
 
 		 901 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.28 
 
 		 901 aa  162  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  31.75 
 
 		 903 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  31.28 
 
 		 901 aa  162  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  31.28 
 
 		 901 aa  162  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  31.75 
 
 		 903 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  31.35 
 
 		 904 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  31.28 
 
 		 901 aa  160  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  31.28 
 
 		 901 aa  160  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.65 
 
 		 960 aa  159  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  34.83 
 
 		 1110 aa  157  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.88 
 
 		 758 aa  157  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.55 
 
 		 1019 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31.95 
 
 		 900 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.53 
 
 		 901 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  30.08 
 
 		 902 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.88 
 
 		 922 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  29.81 
 
 		 902 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.06 
 
 		 1003 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.97 
 
 		 870 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  31.48 
 
 		 899 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  28.26 
 
 		 901 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.47 
 
 		 896 aa  146  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  31.28 
 
 		 913 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.3 
 
 		 1235 aa  142  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 921 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.1 
 
 		 913 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.06 
 
 		 900 aa  137  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  29.43 
 
 		 921 aa  137  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  31.23 
 
 		 914 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 914 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.69 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.69 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.42 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  29.65 
 
 		 919 aa  135  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.45 
 
 		 897 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.45 
 
 		 955 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.86 
 
 		 900 aa  132  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 947 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 906 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 906 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  25.67 
 
 		 891 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  30.29 
 
 		 896 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.32 
 
 		 889 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.17 
 
 		 930 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  32.16 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  31.65 
 
 		 920 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.65 
 
 		 947 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.32 
 
 		 924 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  30.03 
 
 		 916 aa  127  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.27 
 
 		 932 aa  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.46 
 
 		 905 aa  127  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 910 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  33.68 
 
 		 1204 aa  124  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.82 
 
 		 749 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.03 
 
 		 905 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.77 
 
 		 905 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.16 
 
 		 896 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.02 
 
 		 911 aa  121  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  29.18 
 
 		 1336 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.9 
 
 		 928 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  31.47 
 
 		 905 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 905 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  30.91 
 
 		 855 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  32.98 
 
 		 911 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  30.63 
 
 		 913 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.83 
 
 		 901 aa  114  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.57 
 
 		 925 aa  114  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.18 
 
 		 930 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  36.96 
 
 		 840 aa  113  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  32.5 
 
 		 1145 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  29.62 
 
 		 924 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>