More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4838 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  68.24 
 
 
917 aa  1016    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  59.8 
 
 
944 aa  923    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  68.36 
 
 
921 aa  1026    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
900 aa  1742    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  68.24 
 
 
917 aa  1016    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  93.33 
 
 
897 aa  1602    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  93.11 
 
 
955 aa  1595    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  68.13 
 
 
898 aa  1023    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.37 
 
 
888 aa  753    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  69.18 
 
 
928 aa  1125    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  68.24 
 
 
917 aa  1016    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  68.24 
 
 
917 aa  1016    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31.52 
 
 
900 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.11 
 
 
913 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.08 
 
 
922 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.71 
 
 
921 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.71 
 
 
921 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.48 
 
 
921 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.09 
 
 
930 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  29.45 
 
 
960 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29 
 
 
914 aa  220  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  29.03 
 
 
919 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.25 
 
 
894 aa  218  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
947 aa  217  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.85 
 
 
947 aa  211  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.76 
 
 
925 aa  207  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  28.82 
 
 
947 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.2 
 
 
901 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  29.16 
 
 
1336 aa  201  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
921 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.56 
 
 
900 aa  197  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  22.64 
 
 
887 aa  188  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.52 
 
 
896 aa  187  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 
907 aa  184  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  27.61 
 
 
907 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.35 
 
 
901 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
904 aa  181  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.4 
 
 
930 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5436  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.06 
 
 
891 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170631  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.75 
 
 
905 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.95 
 
 
932 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.71 
 
 
910 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.48 
 
 
867 aa  161  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.23 
 
 
913 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.11 
 
 
876 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.35 
 
 
880 aa  159  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.39 
 
 
914 aa  155  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
914 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.4 
 
 
924 aa  152  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.51 
 
 
916 aa  148  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0429  regulatory protein, LuxR  24.84 
 
 
884 aa  146  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.3 
 
 
1021 aa  146  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  28.67 
 
 
896 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  31.21 
 
 
905 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.9 
 
 
870 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.21 
 
 
905 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
905 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.81 
 
 
758 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  26.91 
 
 
1110 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.44 
 
 
905 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.5 
 
 
902 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  26.77 
 
 
878 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  27.65 
 
 
907 aa  132  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  30.64 
 
 
920 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  34.06 
 
 
900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.4 
 
 
897 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  26.04 
 
 
921 aa  128  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.55 
 
 
911 aa  125  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.63 
 
 
902 aa  124  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 
910 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.64 
 
 
904 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 
906 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  34.11 
 
 
899 aa  121  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.07 
 
 
877 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.86 
 
 
906 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  24.59 
 
 
924 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  28.07 
 
 
911 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  27.28 
 
 
913 aa  117  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  28.9 
 
 
914 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.93 
 
 
889 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.63 
 
 
917 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  28.31 
 
 
914 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.41 
 
 
935 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.32 
 
 
953 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.42 
 
 
1003 aa  108  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  25.28 
 
 
901 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.54 
 
 
904 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  25.28 
 
 
901 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  25.28 
 
 
901 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  25.28 
 
 
902 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  29.5 
 
 
824 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  25.28 
 
 
901 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  30.31 
 
 
861 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  25.8 
 
 
901 aa  105  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.72 
 
 
766 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.86 
 
 
730 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  29.88 
 
 
855 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  26.5 
 
 
901 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  26.5 
 
 
901 aa  102  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  26.5 
 
 
901 aa  102  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>