More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0060 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1145 aa  2246    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  47 
 
 		 1163 aa  860    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  85.76 
 
 		 1204 aa  1874    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.98 
 
 		 1111 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  38.69 
 
 		 1108 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  47.67 
 
 		 1083 aa  218  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  46.92 
 
 		 1094 aa  211  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  46.15 
 
 		 1095 aa  209  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  40.74 
 
 		 1097 aa  207  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.95 
 
 		 867 aa  173  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.88 
 
 		 887 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 423 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.17 
 
 		 910 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31.34 
 
 		 900 aa  155  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  30.52 
 
 		 916 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.24 
 
 		 876 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.66 
 
 		 913 aa  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.33 
 
 		 897 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  34.37 
 
 		 907 aa  144  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  30.84 
 
 		 896 aa  143  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.34 
 
 		 766 aa  142  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.12 
 
 		 870 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.13 
 
 		 917 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.52 
 
 		 911 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  35.23 
 
 		 1064 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  30.11 
 
 		 910 aa  135  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.9 
 
 		 1003 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.36 
 
 		 1021 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.14 
 
 		 901 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  26.82 
 
 		 914 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 1190 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.37 
 
 		 905 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  32.78 
 
 		 904 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  35.92 
 
 		 1025 aa  131  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  34.92 
 
 		 1018 aa  131  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.77 
 
 		 749 aa  129  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 921 aa  129  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.25 
 
 		 880 aa  128  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.44 
 
 		 730 aa  128  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.83 
 
 		 1019 aa  128  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 906 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.25 
 
 		 914 aa  127  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.13 
 
 		 896 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  30.02 
 
 		 920 aa  126  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 1193 aa  125  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.02 
 
 		 914 aa  124  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  29.02 
 
 		 894 aa  124  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  29.68 
 
 		 905 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 905 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.43 
 
 		 758 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.03 
 
 		 894 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.3 
 
 		 904 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.04 
 
 		 905 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  27.19 
 
 		 902 aa  122  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  26.4 
 
 		 902 aa  122  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.8 
 
 		 999 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.59 
 
 		 930 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.8 
 
 		 900 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 		 906 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.17 
 
 		 901 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 907 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.24 
 
 		 922 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 		 1000 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 		 911 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 907 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.24 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.24 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30 
 
 		 921 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  28.24 
 
 		 901 aa  115  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.89 
 
 		 561 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 924 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.2 
 
 		 878 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.64 
 
 		 877 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.23 
 
 		 905 aa  112  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.98 
 
 		 913 aa  112  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  27.51 
 
 		 901 aa  112  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  32.89 
 
 		 900 aa  112  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.51 
 
 		 902 aa  112  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  27.51 
 
 		 901 aa  111  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  27.51 
 
 		 901 aa  111  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  27.51 
 
 		 901 aa  111  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  26.36 
 
 		 1082 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 		 824 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 1031 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.16 
 
 		 1055 aa  109  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  28.12 
 
 		 921 aa  109  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.4 
 
 		 901 aa  109  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.4 
 
 		 901 aa  109  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.4 
 
 		 901 aa  109  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.4 
 
 		 901 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.4 
 
 		 901 aa  108  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.84 
 
 		 572 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.11 
 
 		 932 aa  108  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.4 
 
 		 901 aa  108  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 901 aa  108  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 775 aa  107  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  26.37 
 
 		 921 aa  107  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  31.04 
 
 		 985 aa  107  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  25.81 
 
 		 954 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  27.86 
 
 		 913 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>