More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2742 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  47.55 
 
 		 1336 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  46.02 
 
 		 960 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48 
 
 		 947 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 930 aa  1847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  53.79 
 
 		 925 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 947 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  53.27 
 
 		 919 aa  814    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.32 
 
 		 900 aa  258  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.32 
 
 		 913 aa  254  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 921 aa  249  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  29.15 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.89 
 
 		 914 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.45 
 
 		 947 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.75 
 
 		 928 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 		 955 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  29.1 
 
 		 944 aa  231  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.08 
 
 		 897 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  24.11 
 
 		 887 aa  220  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.52 
 
 		 900 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.13 
 
 		 896 aa  206  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.64 
 
 		 894 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.03 
 
 		 922 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 924 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  27.49 
 
 		 896 aa  201  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.93 
 
 		 904 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 898 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  29.78 
 
 		 921 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.54 
 
 		 877 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.51 
 
 		 1019 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.71 
 
 		 905 aa  194  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 917 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 917 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 917 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 917 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  26.42 
 
 		 878 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.54 
 
 		 901 aa  189  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 901 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.34 
 
 		 1003 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.19 
 
 		 932 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.71 
 
 		 921 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.65 
 
 		 933 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.69 
 
 		 910 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  26.46 
 
 		 913 aa  183  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.71 
 
 		 921 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.71 
 
 		 921 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.75 
 
 		 924 aa  181  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 914 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.71 
 
 		 880 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 904 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.89 
 
 		 1021 aa  173  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.58 
 
 		 766 aa  172  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.8 
 
 		 876 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.66 
 
 		 930 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.06 
 
 		 916 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.16 
 
 		 914 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.62 
 
 		 867 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  26.19 
 
 		 913 aa  164  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.06 
 
 		 870 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  27.75 
 
 		 1110 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.39 
 
 		 889 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.01 
 
 		 888 aa  154  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  26.18 
 
 		 824 aa  152  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  26.63 
 
 		 914 aa  152  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.01 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  24.56 
 
 		 921 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  29.2 
 
 		 920 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 907 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 906 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  29.4 
 
 		 907 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.1 
 
 		 896 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  29.98 
 
 		 907 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.65 
 
 		 758 aa  134  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  28.73 
 
 		 906 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  24.95 
 
 		 894 aa  131  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.92 
 
 		 901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.71 
 
 		 905 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.28 
 
 		 1097 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.49 
 
 		 905 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  32.23 
 
 		 732 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 910 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.73 
 
 		 901 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 905 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  23.19 
 
 		 914 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  27.15 
 
 		 902 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.28 
 
 		 897 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.59 
 
 		 904 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5021  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 855 aa  118  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00982675  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  27.75 
 
 		 905 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  26.91 
 
 		 902 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  25.42 
 
 		 901 aa  117  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  26.62 
 
 		 902 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.62 
 
 		 901 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  26.85 
 
 		 901 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  26.85 
 
 		 901 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  26.85 
 
 		 901 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  28.24 
 
 		 899 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.85 
 
 		 919 aa  114  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.86 
 
 		 907 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  28.17 
 
 		 900 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  27.15 
 
 		 921 aa  111  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>