More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1524 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  100 
 
 
907 aa  1685    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  38.73 
 
 
900 aa  321  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.19 
 
 
884 aa  273  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.6 
 
 
876 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.91 
 
 
935 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.19 
 
 
1021 aa  266  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.6 
 
 
880 aa  260  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.98 
 
 
953 aa  259  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.47 
 
 
1019 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.5 
 
 
910 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.01 
 
 
904 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.8 
 
 
877 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.34 
 
 
846 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.57 
 
 
903 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.57 
 
 
903 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 
867 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.79 
 
 
917 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 
921 aa  211  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  27.74 
 
 
887 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.02 
 
 
947 aa  208  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  28.24 
 
 
916 aa  206  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  31.1 
 
 
824 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  38.14 
 
 
897 aa  204  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.95 
 
 
766 aa  197  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.16 
 
 
901 aa  194  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  26.16 
 
 
901 aa  194  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.62 
 
 
930 aa  193  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  26.26 
 
 
901 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  26.16 
 
 
901 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  26.26 
 
 
901 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.55 
 
 
914 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  26.16 
 
 
901 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  26.16 
 
 
901 aa  190  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  26.16 
 
 
901 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  25.16 
 
 
902 aa  188  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.85 
 
 
870 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  25.05 
 
 
902 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.84 
 
 
901 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
921 aa  179  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  30.39 
 
 
901 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  30.39 
 
 
901 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  30.39 
 
 
901 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  30.39 
 
 
902 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  30.39 
 
 
901 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  29.3 
 
 
901 aa  178  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.04 
 
 
922 aa  174  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.43 
 
 
758 aa  170  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.57 
 
 
894 aa  168  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.18 
 
 
913 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
914 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27 
 
 
900 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  35.02 
 
 
904 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 
913 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.91 
 
 
924 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.6 
 
 
932 aa  156  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.54 
 
 
905 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  34.38 
 
 
749 aa  151  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.39 
 
 
905 aa  149  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  30.94 
 
 
906 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  32.86 
 
 
924 aa  148  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  30.62 
 
 
913 aa  148  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  34.22 
 
 
905 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  30.7 
 
 
899 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.48 
 
 
905 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
905 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  33.25 
 
 
920 aa  144  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.86 
 
 
930 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
904 aa  142  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.24 
 
 
889 aa  141  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  29.61 
 
 
894 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
901 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  27.26 
 
 
914 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.98 
 
 
1235 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  34.55 
 
 
911 aa  138  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.98 
 
 
911 aa  137  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  33.69 
 
 
919 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  31.1 
 
 
896 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.4 
 
 
947 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  32.9 
 
 
907 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 
907 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.41 
 
 
730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 
914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.36 
 
 
901 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.08 
 
 
901 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.43 
 
 
896 aa  127  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.35 
 
 
896 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  30.22 
 
 
1110 aa  127  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  32.27 
 
 
732 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  34.31 
 
 
756 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 
878 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.17 
 
 
854 aa  122  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  31.86 
 
 
717 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  31.4 
 
 
1082 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  31.27 
 
 
1000 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  29.98 
 
 
1336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
947 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  31.79 
 
 
960 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  31.15 
 
 
1061 aa  114  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.99 
 
 
860 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  30.54 
 
 
1145 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>