185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0766 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1000 aa  2053    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  54.91 
 
 		 1082 aa  1088    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  35.64 
 
 		 1055 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  32.96 
 
 		 1061 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  31.57 
 
 		 1071 aa  493  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  30.08 
 
 		 1031 aa  386  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  26.98 
 
 		 689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.5 
 
 		 1019 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  25.94 
 
 		 887 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.16 
 
 		 766 aa  145  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.61 
 
 		 1021 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.82 
 
 		 1204 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  21.58 
 
 		 977 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  26.4 
 
 		 901 aa  130  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  26.94 
 
 		 1145 aa  128  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  28.46 
 
 		 921 aa  127  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  127  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.12 
 
 		 877 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.2 
 
 		 1111 aa  126  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.36 
 
 		 916 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.04 
 
 		 870 aa  124  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 901 aa  124  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.47 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 901 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  27.29 
 
 		 903 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  27.29 
 
 		 903 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.47 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  25.22 
 
 		 901 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  25.22 
 
 		 902 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  25.22 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  26.94 
 
 		 904 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  25.22 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  25.22 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.07 
 
 		 897 aa  120  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.81 
 
 		 913 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.95 
 
 		 913 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.16 
 
 		 901 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.51 
 
 		 867 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  25.93 
 
 		 914 aa  118  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 906 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  29.1 
 
 		 902 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  27.84 
 
 		 902 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  28.39 
 
 		 913 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.29 
 
 		 876 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.87 
 
 		 910 aa  114  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  25.92 
 
 		 906 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.61 
 
 		 907 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  27.76 
 
 		 896 aa  113  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  28.71 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  21.8 
 
 		 1108 aa  109  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.99 
 
 		 914 aa  108  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.77 
 
 		 730 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.53 
 
 		 919 aa  104  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.27 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  28.2 
 
 		 756 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  26.01 
 
 		 920 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.93 
 
 		 880 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.21 
 
 		 889 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.7 
 
 		 922 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.52 
 
 		 930 aa  100  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.36 
 
 		 1003 aa  98.6  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.95 
 
 		 860 aa  98.2  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.5 
 
 		 846 aa  98.2  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  23.35 
 
 		 917 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.32 
 
 		 900 aa  94.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.77 
 
 		 749 aa  94.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  25.99 
 
 		 1163 aa  94.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  27.07 
 
 		 878 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 904 aa  92.8  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  24.4 
 
 		 910 aa  92  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  27.05 
 
 		 717 aa  92  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  23.32 
 
 		 914 aa  92  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.88 
 
 		 905 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.7 
 
 		 924 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  25.79 
 
 		 1068 aa  89  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  24.31 
 
 		 1097 aa  88.6  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25.51 
 
 		 900 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  27.95 
 
 		 985 aa  87.4  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.18 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.65 
 
 		 894 aa  87  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  24.31 
 
 		 907 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.16 
 
 		 935 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.91 
 
 		 921 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.91 
 
 		 921 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  24.15 
 
 		 905 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.6 
 
 		 884 aa  84.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 993 aa  82.8  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  25.97 
 
 		 899 aa  82.8  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 905 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 914 aa  82.4  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.67 
 
 		 905 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  26.79 
 
 		 919 aa  82  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  26.05 
 
 		 1070 aa  81.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.05 
 
 		 947 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.4 
 
 		 905 aa  79.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.12 
 
 		 911 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>