165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1633 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1031 aa  2075    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  29.01 
 
 		 1082 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  29.97 
 
 		 1000 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  28.9 
 
 		 1055 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  30.16 
 
 		 1071 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.85 
 
 		 1061 aa  343  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 689 aa  180  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.19 
 
 		 880 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.84 
 
 		 1204 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.32 
 
 		 1019 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24 
 
 		 1111 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.92 
 
 		 766 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  26.58 
 
 		 977 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  30.44 
 
 		 732 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 		 1145 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  25.68 
 
 		 901 aa  101  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.32 
 
 		 1021 aa  99.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.41 
 
 		 887 aa  98.6  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.45 
 
 		 919 aa  98.6  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  23.89 
 
 		 921 aa  98.6  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 903 aa  99  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  27.47 
 
 		 903 aa  99  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 921 aa  97.8  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  23.96 
 
 		 1095 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  24.52 
 
 		 1108 aa  96.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.3 
 
 		 867 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.95 
 
 		 901 aa  95.9  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.55 
 
 		 758 aa  93.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.95 
 
 		 904 aa  93.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  25.94 
 
 		 904 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.12 
 
 		 902 aa  90.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  25.67 
 
 		 901 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  25.67 
 
 		 902 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  25.67 
 
 		 901 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  25.67 
 
 		 901 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  26.62 
 
 		 878 aa  89.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  25.33 
 
 		 902 aa  89.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  25.67 
 
 		 901 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.75 
 
 		 914 aa  89  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  26.54 
 
 		 901 aa  89  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.71 
 
 		 897 aa  89  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.53 
 
 		 896 aa  88.6  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.6 
 
 		 914 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.24 
 
 		 913 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  27.36 
 
 		 717 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 924 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  25.13 
 
 		 1068 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  26.09 
 
 		 901 aa  85.5  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  26.09 
 
 		 901 aa  85.5  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 914 aa  85.1  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.14 
 
 		 910 aa  84.7  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  23.79 
 
 		 954 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.37 
 
 		 881 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.58 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  25.83 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  24.15 
 
 		 900 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  25.83 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  25.58 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  25.58 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.82 
 
 		 846 aa  82.8  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  24.01 
 
 		 913 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  24.76 
 
 		 913 aa  82  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  25.32 
 
 		 901 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  23.98 
 
 		 1070 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  26.88 
 
 		 1110 aa  82  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.59 
 
 		 905 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.46 
 
 		 916 aa  81.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.62 
 
 		 914 aa  81.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 904 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.12 
 
 		 905 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.24 
 
 		 749 aa  80.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.31 
 
 		 907 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.06 
 
 		 870 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.2 
 
 		 876 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  26.72 
 
 		 824 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.76 
 
 		 877 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.01 
 
 		 930 aa  76.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  23.66 
 
 		 969 aa  77  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  26.79 
 
 		 756 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 		 911 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.37 
 
 		 922 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  27.36 
 
 		 914 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  25.78 
 
 		 910 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.26 
 
 		 924 aa  75.1  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.16 
 
 		 932 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 905 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  24.54 
 
 		 894 aa  74.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  23.47 
 
 		 896 aa  74.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  25.06 
 
 		 1163 aa  74.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  25.91 
 
 		 1102 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  26.32 
 
 		 920 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.55 
 
 		 730 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 906 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.2 
 
 		 889 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  25.72 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  26.42 
 
 		 905 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  26.14 
 
 		 947 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.41 
 
 		 921 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 901 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>