176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0292 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  100 
 
 		 954 aa  1972    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  33.48 
 
 		 969 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1442  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  35.42 
 
 		 291 aa  160  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.91 
 
 		 749 aa  134  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  26.03 
 
 		 901 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.49 
 
 		 897 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1441  hypothetical protein  35.9 
 
 		 195 aa  126  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  26.17 
 
 		 1108 aa  126  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.67 
 
 		 867 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  25.33 
 
 		 902 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  25.33 
 
 		 902 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  25.51 
 
 		 896 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.88 
 
 		 766 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  24.69 
 
 		 1097 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.97 
 
 		 910 aa  116  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.2 
 
 		 901 aa  115  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.49 
 
 		 1021 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  25.78 
 
 		 913 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  25.53 
 
 		 913 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.09 
 
 		 913 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.21 
 
 		 887 aa  111  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  24.74 
 
 		 921 aa  111  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.79 
 
 		 758 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.03 
 
 		 917 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.79 
 
 		 877 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 914 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  26.41 
 
 		 855 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.81 
 
 		 894 aa  103  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  23.86 
 
 		 916 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  24.17 
 
 		 904 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  24.82 
 
 		 1204 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.96 
 
 		 1003 aa  101  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  22.09 
 
 		 901 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  22.09 
 
 		 901 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  22.09 
 
 		 901 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  22.09 
 
 		 901 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.44 
 
 		 930 aa  99.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.09 
 
 		 889 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  23.24 
 
 		 902 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.81 
 
 		 846 aa  99  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 904 aa  98.6  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24 
 
 		 896 aa  97.8  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.98 
 
 		 914 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.08 
 
 		 905 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  23.54 
 
 		 901 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  22.76 
 
 		 901 aa  95.9  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  25.81 
 
 		 1145 aa  95.9  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  23.54 
 
 		 901 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  23.6 
 
 		 900 aa  94.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  23.54 
 
 		 901 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  23.54 
 
 		 901 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.65 
 
 		 900 aa  94.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.19 
 
 		 1019 aa  94.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  23.54 
 
 		 901 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  23.54 
 
 		 901 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25.76 
 
 		 1111 aa  94.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  23.54 
 
 		 901 aa  94.4  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  23.54 
 
 		 901 aa  94.4  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.18 
 
 		 870 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  23.34 
 
 		 903 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  23.34 
 
 		 903 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.05 
 
 		 905 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  25.22 
 
 		 695 aa  92.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  22.06 
 
 		 904 aa  92  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  23.43 
 
 		 1102 aa  92  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  23.7 
 
 		 920 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.57 
 
 		 930 aa  91.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 905 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.96 
 
 		 955 aa  90.9  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  21.92 
 
 		 933 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  22.66 
 
 		 906 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  26.19 
 
 		 1336 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.77 
 
 		 876 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 901 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.08 
 
 		 905 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.6 
 
 		 840 aa  89.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  24.51 
 
 		 894 aa  89.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  24.32 
 
 		 907 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.94 
 
 		 897 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.87 
 
 		 884 aa  89  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  23.01 
 
 		 919 aa  89  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  21.3 
 
 		 905 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  22.83 
 
 		 899 aa  88.6  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  24.3 
 
 		 924 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 906 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  22.61 
 
 		 947 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.72 
 
 		 922 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.96 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.96 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.96 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.14 
 
 		 932 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 993 aa  86.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.64 
 
 		 924 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  22.2 
 
 		 910 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  21.9 
 
 		 914 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.27 
 
 		 911 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  22.74 
 
 		 914 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.4 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  21.95 
 
 		 1082 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>