176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0954 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 993 aa  1865    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  31.43 
 
 		 1097 aa  249  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1658  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 870 aa  223  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0923542  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  30.62 
 
 		 1094 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  29.97 
 
 		 1095 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2325  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 920 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  31.58 
 
 		 1083 aa  183  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  30.79 
 
 		 1108 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  30.9 
 
 		 947 aa  108  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  28.77 
 
 		 894 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.88 
 
 		 897 aa  106  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.86 
 
 		 932 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 904 aa  102  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.68 
 
 		 924 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.77 
 
 		 1021 aa  100  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.81 
 
 		 749 aa  98.6  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.18 
 
 		 905 aa  98.6  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.77 
 
 		 877 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  28.97 
 
 		 913 aa  97.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.61 
 
 		 1204 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  25.06 
 
 		 902 aa  96.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 921 aa  96.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.93 
 
 		 766 aa  95.9  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  25.9 
 
 		 901 aa  96.3  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  30.08 
 
 		 896 aa  94.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  34.91 
 
 		 919 aa  94.4  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.66 
 
 		 930 aa  93.6  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.46 
 
 		 1111 aa  93.6  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.83 
 
 		 1019 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.99 
 
 		 933 aa  92.8  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  34.95 
 
 		 1163 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.84 
 
 		 896 aa  92  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.51 
 
 		 913 aa  91.3  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  26.32 
 
 		 902 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  26.98 
 
 		 954 aa  91.3  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.94 
 
 		 902 aa  91.3  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  26.32 
 
 		 901 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  26.32 
 
 		 901 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  26.32 
 
 		 901 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.71 
 
 		 921 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.71 
 
 		 921 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 921 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.09 
 
 		 901 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.69 
 
 		 910 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.81 
 
 		 903 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  26.86 
 
 		 901 aa  89.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.63 
 
 		 921 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.81 
 
 		 903 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.25 
 
 		 889 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.97 
 
 		 922 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  28.94 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  32.36 
 
 		 1145 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.27 
 
 		 867 aa  85.1  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.52 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.04 
 
 		 1061 aa  84.7  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  32.41 
 
 		 717 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  28.17 
 
 		 1000 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  29.47 
 
 		 907 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.49 
 
 		 896 aa  82  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 		 901 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 		 901 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 		 901 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 		 901 aa  82  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.23 
 
 		 901 aa  81.6  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 		 901 aa  81.6  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  27.38 
 
 		 914 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  28.23 
 
 		 901 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.53 
 
 		 887 aa  80.9  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  30.89 
 
 		 1064 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  28.23 
 
 		 901 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.08 
 
 		 904 aa  80.9  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.85 
 
 		 914 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  33.33 
 
 		 985 aa  79.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.74 
 
 		 905 aa  79.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.05 
 
 		 901 aa  79.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  29.03 
 
 		 1068 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 914 aa  77.4  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  32.6 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.04 
 
 		 895 aa  77  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  25.77 
 
 		 914 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.9 
 
 		 894 aa  75.5  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  25.4 
 
 		 1031 aa  75.5  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  27.41 
 
 		 1110 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3636  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.46 
 
 		 953 aa  75.5  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.22 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 907 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 906 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.26 
 
 		 917 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  29.18 
 
 		 960 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 907 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  31.94 
 
 		 990 aa  74.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.59 
 
 		 955 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.59 
 
 		 897 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  26.43 
 
 		 695 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  27.07 
 
 		 899 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  30.96 
 
 		 1102 aa  71.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 906 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.59 
 
 		 900 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.41 
 
 		 930 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  29.94 
 
 		 855 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>