More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0745 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  100 
 
 
895 aa  1709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  37.34 
 
 
840 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.14 
 
 
903 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.14 
 
 
903 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  28.31 
 
 
904 aa  140  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  27.55 
 
 
901 aa  137  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  24.28 
 
 
921 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  27.09 
 
 
901 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  27.09 
 
 
901 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  27.09 
 
 
901 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.09 
 
 
902 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.99 
 
 
901 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  26.12 
 
 
901 aa  128  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  26.38 
 
 
901 aa  128  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.38 
 
 
901 aa  128  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  26.38 
 
 
901 aa  128  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  26.58 
 
 
901 aa  128  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  26.12 
 
 
901 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  26.18 
 
 
901 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  28.34 
 
 
896 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  26.18 
 
 
901 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.26 
 
 
910 aa  124  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  20.77 
 
 
887 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.25 
 
 
730 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  26.22 
 
 
902 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.82 
 
 
1021 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.18 
 
 
914 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  26.72 
 
 
902 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30 
 
 
913 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.05 
 
 
1003 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.73 
 
 
901 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  30.24 
 
 
900 aa  103  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.75 
 
 
766 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 
919 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  29.79 
 
 
1097 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.96 
 
 
914 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.12 
 
 
867 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  29.31 
 
 
1094 aa  99  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  25.12 
 
 
901 aa  98.6  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  30.61 
 
 
924 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.79 
 
 
960 aa  96.3  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.63 
 
 
930 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.18 
 
 
897 aa  95.9  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  28.42 
 
 
1336 aa  95.1  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.63 
 
 
921 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.8 
 
 
913 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.65 
 
 
947 aa  94  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.07 
 
 
758 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.97 
 
 
906 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.51 
 
 
905 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  29.29 
 
 
920 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.54 
 
 
947 aa  91.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 
906 aa  91.3  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.85 
 
 
877 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  29.23 
 
 
904 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  31.7 
 
 
919 aa  88.6  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.98 
 
 
884 aa  88.6  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
905 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 
905 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.9 
 
 
925 aa  88.2  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 
901 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
904 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.74 
 
 
905 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  26.93 
 
 
913 aa  87  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.75 
 
 
749 aa  85.9  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.92 
 
 
876 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  20.13 
 
 
896 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.85 
 
 
916 aa  85.1  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  27.96 
 
 
914 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.3 
 
 
911 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.79 
 
 
917 aa  84.7  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  27.01 
 
 
914 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  26.97 
 
 
910 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.83 
 
 
947 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.43 
 
 
846 aa  83.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.48 
 
 
905 aa  83.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.38 
 
 
924 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  28.14 
 
 
907 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
993 aa  82  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  24.05 
 
 
954 aa  81.6  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.33 
 
 
935 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.16 
 
 
933 aa  80.5  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  27.01 
 
 
1110 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  28.4 
 
 
1070 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.54 
 
 
894 aa  79  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.52 
 
 
1204 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.86 
 
 
1163 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.49 
 
 
896 aa  78.2  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.05 
 
 
1019 aa  77.8  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.27 
 
 
899 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  26.95 
 
 
756 aa  77.4  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
914 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.47 
 
 
900 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  29.34 
 
 
717 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.22 
 
 
922 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.1 
 
 
930 aa  75.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  29.84 
 
 
732 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.26 
 
 
932 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.88 
 
 
900 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  26.74 
 
 
1082 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>