289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0699 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1094 aa  2165    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  84.66 
 
 		 1095 aa  1843    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  51.32 
 
 		 1083 aa  887    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  34.65 
 
 		 1097 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  29.05 
 
 		 1108 aa  283  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  44.04 
 
 		 1204 aa  211  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  46.92 
 
 		 1145 aa  202  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  39.05 
 
 		 1163 aa  184  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 423 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 993 aa  121  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1193 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1658  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 870 aa  119  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0923542  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  35.41 
 
 		 1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 1190 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  35.21 
 
 		 1025 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  28.18 
 
 		 900 aa  114  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.45 
 
 		 561 aa  112  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.59 
 
 		 572 aa  109  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.68 
 
 		 881 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.57 
 
 		 910 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.01 
 
 		 904 aa  103  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.54 
 
 		 999 aa  103  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.08 
 
 		 922 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  35.22 
 
 		 1109 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.08 
 
 		 661 aa  102  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 921 aa  101  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  33.04 
 
 		 1064 aa  101  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.27 
 
 		 870 aa  99  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.92 
 
 		 867 aa  97.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.63 
 
 		 901 aa  97.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 775 aa  97.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.83 
 
 		 897 aa  96.3  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  32 
 
 		 1116 aa  94.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.67 
 
 		 766 aa  94  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  29.7 
 
 		 913 aa  94.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25.87 
 
 		 1111 aa  93.6  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.69 
 
 		 921 aa  92.8  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.69 
 
 		 921 aa  92.8  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.79 
 
 		 901 aa  92  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.81 
 
 		 917 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.69 
 
 		 921 aa  92  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.79 
 
 		 901 aa  92  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.79 
 
 		 901 aa  92  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.79 
 
 		 901 aa  92  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.79 
 
 		 901 aa  92  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.79 
 
 		 901 aa  92  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.79 
 
 		 901 aa  92  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.79 
 
 		 901 aa  91.7  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.6 
 
 		 913 aa  91.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.57 
 
 		 887 aa  91.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.94 
 
 		 896 aa  91.3  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 901 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 901 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 901 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  25.69 
 
 		 901 aa  90.9  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 902 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 901 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.24 
 
 		 1003 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  28.16 
 
 		 1082 aa  90.1  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.97 
 
 		 878 aa  89.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2325  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 920 aa  89.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  32.4 
 
 		 1118 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  32.4 
 
 		 1118 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.46 
 
 		 1021 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  34.29 
 
 		 1126 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.99 
 
 		 877 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.87 
 
 		 903 aa  86.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.87 
 
 		 903 aa  86.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  27.71 
 
 		 904 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.75 
 
 		 914 aa  85.1  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  29.02 
 
 		 1061 aa  84.7  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.67 
 
 		 924 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  23.29 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.25 
 
 		 933 aa  84  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.07 
 
 		 930 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.46 
 
 		 846 aa  83.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.89 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.24 
 
 		 889 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.6 
 
 		 916 aa  82  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  26.2 
 
 		 896 aa  81.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  31.45 
 
 		 1009 aa  81.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.75 
 
 		 913 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  31.79 
 
 		 960 aa  78.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  28.99 
 
 		 894 aa  77.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  30.92 
 
 		 1183 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.43 
 
 		 1055 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.45 
 
 		 932 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  29.08 
 
 		 965 aa  76.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.47 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  27.54 
 
 		 867 aa  75.5  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  27.46 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.8 
 
 		 919 aa  74.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  33.22 
 
 		 900 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  27.34 
 
 		 899 aa  73.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.14 
 
 		 902 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.85 
 
 		 895 aa  73.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.84 
 
 		 860 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.9 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  26.87 
 
 		 1068 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.61 
 
 		 1235 aa  71.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>