177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2405 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  65.38 
 
 		 1018 aa  1194    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1025 aa  1935    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  35.84 
 
 		 1163 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  35.92 
 
 		 1145 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  35.21 
 
 		 1094 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  35.14 
 
 		 1083 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  33.08 
 
 		 1095 aa  118  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  31.8 
 
 		 1097 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  31.6 
 
 		 1108 aa  104  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 423 aa  101  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  37.07 
 
 		 1064 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.28 
 
 		 1111 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.38 
 
 		 661 aa  84  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 1193 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 1190 aa  81.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  32.03 
 
 		 900 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.95 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.21 
 
 		 913 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  30.79 
 
 		 896 aa  75.5  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  27.41 
 
 		 904 aa  74.3  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.91 
 
 		 880 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  29.8 
 
 		 890 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28.67 
 
 		 1204 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  29.78 
 
 		 268 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  29.9 
 
 		 1061 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.86 
 
 		 921 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.98 
 
 		 914 aa  72.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  27.33 
 
 		 901 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.9 
 
 		 561 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.81 
 
 		 887 aa  70.1  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.73 
 
 		 917 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 		 888 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  29.43 
 
 		 1068 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.59 
 
 		 897 aa  69.7  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.97 
 
 		 860 aa  68.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.92 
 
 		 1126 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  28.34 
 
 		 913 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 904 aa  67.4  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.8 
 
 		 905 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.77 
 
 		 1021 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.91 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.85 
 
 		 910 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.45 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.32 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.63 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  26.63 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  26.63 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  26.63 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  26.63 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 947 aa  65.1  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.04 
 
 		 900 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.12 
 
 		 902 aa  64.7  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 921 aa  64.7  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 786 aa  64.7  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.01 
 
 		 901 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  26.01 
 
 		 901 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.83 
 
 		 889 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 		 922 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  33.48 
 
 		 900 aa  64.3  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  28.78 
 
 		 913 aa  64.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.26 
 
 		 870 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  26.01 
 
 		 901 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 914 aa  63.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  26.28 
 
 		 916 aa  63.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.46 
 
 		 1118 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  28.2 
 
 		 1070 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  28.41 
 
 		 960 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  25.08 
 
 		 903 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  25.08 
 
 		 903 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  16.93 
 
 		 1055 aa  62.4  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.29 
 
 		 1067 aa  62  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  29.55 
 
 		 867 aa  61.6  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  33.33 
 
 		 1143 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.43 
 
 		 914 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  28.99 
 
 		 689 aa  61.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  26.73 
 
 		 894 aa  60.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.56 
 
 		 824 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.28 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.96 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  28.62 
 
 		 855 aa  59.7  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.32 
 
 		 921 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.32 
 
 		 921 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.69 
 
 		 867 aa  59.3  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.91 
 
 		 899 aa  58.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 993 aa  58.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.55 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  25.93 
 
 		 756 aa  57.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1442  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.04 
 
 		 291 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.54 
 
 		 1109 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  34.07 
 
 		 1699 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  26.83 
 
 		 944 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>