80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2003 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 867 aa  1721    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  42.69 
 
 		 831 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.58 
 
 		 907 aa  163  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  30.47 
 
 		 1108 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  28.62 
 
 		 1083 aa  84.3  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  28.97 
 
 		 1163 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28 
 
 		 1204 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.97 
 
 		 572 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 		 1082 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  27.54 
 
 		 1094 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  29.7 
 
 		 1145 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.09 
 
 		 1095 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  24.6 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.02 
 
 		 1097 aa  65.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 1116 aa  64.7  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  27.95 
 
 		 661 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  26.51 
 
 		 1109 aa  61.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  26.38 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  29.33 
 
 		 1064 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.8 
 
 		 999 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  22.98 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  28.63 
 
 		 1118 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  28.63 
 
 		 1118 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  29.37 
 
 		 990 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  29.55 
 
 		 1025 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  29.5 
 
 		 1018 aa  57.4  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  27.43 
 
 		 494 aa  57  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  27 
 
 		 535 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 423 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  26.49 
 
 		 991 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  23.87 
 
 		 449 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 446 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 1190 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  28.87 
 
 		 1020 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3859  transcriptional regulator, SARP family  26.62 
 
 		 261 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  20.63 
 
 		 1111 aa  52  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.41 
 
 		 1143 aa  51.6  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 1193 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 289 aa  50.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  31.07 
 
 		 1049 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  27.86 
 
 		 957 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  26.69 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 582 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.08 
 
 		 919 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  29.15 
 
 		 1044 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  28.68 
 
 		 970 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  27.13 
 
 		 1021 aa  48.5  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 647 aa  48.5  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.19 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  24.62 
 
 		 931 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26 
 
 		 1148 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  28.9 
 
 		 962 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  28.63 
 
 		 666 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  28.86 
 
 		 244 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  25.86 
 
 		 621 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  25.51 
 
 		 1013 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  22.86 
 
 		 312 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 292 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.61 
 
 		 713 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 1050 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 1043 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 309 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  29.33 
 
 		 1030 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 1025 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 775 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 378 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 		 261 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 723 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  36.17 
 
 		 1083 aa  45.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  27.64 
 
 		 940 aa  44.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  24.51 
 
 		 277 aa  44.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  20.68 
 
 		 349 aa  44.3  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 968 aa  44.3  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  23.58 
 
 		 689 aa  44.3  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>