109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2896 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0014  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  42.08 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 775 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  29.67 
 
 		 365 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  32.1 
 
 		 1163 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  31.6 
 
 		 1145 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  30.8 
 
 		 1204 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  29.08 
 
 		 1111 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.2 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  26 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.89 
 
 		 1056 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  28.85 
 
 		 1044 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  28.51 
 
 		 985 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 1064 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.8 
 
 		 572 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  30.34 
 
 		 1094 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  28.09 
 
 		 1095 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.34 
 
 		 1013 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  27.71 
 
 		 1075 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 1190 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 1193 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  30.47 
 
 		 1083 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  29.82 
 
 		 1009 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.24 
 
 		 1108 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.53 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  28.63 
 
 		 1061 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.8 
 
 		 1109 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  26.53 
 
 		 1055 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  32.34 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.97 
 
 		 1034 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.69 
 
 		 1055 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3418  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 973 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 992 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.75 
 
 		 1029 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.27 
 
 		 1139 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  29.85 
 
 		 1025 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 1116 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.89 
 
 		 1145 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  25.71 
 
 		 1082 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 1217 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  27.86 
 
 		 1097 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  26.12 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 952 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  28.44 
 
 		 1018 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.31 
 
 		 992 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  28.02 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  25.83 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  28.8 
 
 		 1183 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  24.79 
 
 		 921 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.03 
 
 		 999 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 1050 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 1030 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  26.98 
 
 		 575 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0439  SARP family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 630 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25 
 
 		 1067 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  29.11 
 
 		 1000 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.15 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.15 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  26.21 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 636 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 1216 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  26.46 
 
 		 1000 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  26.94 
 
 		 1003 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  26.07 
 
 		 1071 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  27.6 
 
 		 1003 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  26.73 
 
 		 935 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  27.88 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  27.44 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.46 
 
 		 1126 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  26.45 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.02 
 
 		 1100 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  23.17 
 
 		 996 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 		 931 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.77 
 
 		 496 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.41 
 
 		 631 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  26.17 
 
 		 957 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  27.27 
 
 		 597 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  43.1 
 
 		 1143 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  26.67 
 
 		 907 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.55 
 
 		 988 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  25.44 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  24.66 
 
 		 981 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  26.34 
 
 		 965 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  24.78 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 535 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  31.9 
 
 		 991 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3859  transcriptional regulator, SARP family  43.4 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  27.95 
 
 		 990 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01150  PAS domain-containing protein  26.95 
 
 		 524 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00148391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  24.88 
 
 		 621 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  23.51 
 
 		 914 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  24.69 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  28.25 
 
 		 526 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 689 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  30.61 
 
 		 1119 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>