113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4971 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  48.96 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  45.53 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  45.85 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  47.83 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  48.03 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  43.86 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.73 
 
 		 1034 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 1050 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  30.93 
 
 		 1139 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.62 
 
 		 1075 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  32.79 
 
 		 1067 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  27.53 
 
 		 1111 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.54 
 
 		 494 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 1089 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.28 
 
 		 965 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.81 
 
 		 1029 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  28.69 
 
 		 1083 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.15 
 
 		 1204 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.3 
 
 		 1055 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  26.61 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 1000 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 		 1145 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  30.3 
 
 		 1163 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.19 
 
 		 1126 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 636 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.78 
 
 		 1163 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.04 
 
 		 1339 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 760 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  28.16 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  31.38 
 
 		 1087 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.9 
 
 		 963 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 952 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  24.89 
 
 		 1082 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  22.05 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.91 
 
 		 831 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 935 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.25 
 
 		 981 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 962 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.65 
 
 		 572 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 1064 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.13 
 
 		 496 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 775 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.23 
 
 		 713 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 611 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  28.8 
 
 		 907 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  30.08 
 
 		 597 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.66 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  30.13 
 
 		 650 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 910 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  30.21 
 
 		 915 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  37.04 
 
 		 1108 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  25.2 
 
 		 1094 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 622 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  37.25 
 
 		 1044 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 489 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.2 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  27 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  25.91 
 
 		 1145 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  25.12 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  42.34 
 
 		 919 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  31.17 
 
 		 641 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 1054 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 655 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  27.27 
 
 		 1018 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  24.39 
 
 		 1095 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  37.89 
 
 		 1114 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  25 
 
 		 1090 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.93 
 
 		 999 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.17 
 
 		 1088 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 1216 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 453 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 		 867 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 		 549 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.86 
 
 		 960 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1153 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  27.2 
 
 		 621 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  30.18 
 
 		 926 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 1042 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.14 
 
 		 1056 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  29.92 
 
 		 1034 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  29.63 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 1148 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 1043 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  32.33 
 
 		 1143 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 911 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.79 
 
 		 1030 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 1141 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 1141 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>