206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1552 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  566  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  32.97 
 
 		 990 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 1190 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 1093 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 1028 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 1193 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30.5 
 
 		 990 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 963 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 1158 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  31.6 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 1000 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  32.17 
 
 		 1064 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 654 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 1043 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 1148 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 1141 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 1054 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.8 
 
 		 1204 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  32.44 
 
 		 1131 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  30.57 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 1058 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 993 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.16 
 
 		 1003 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.62 
 
 		 1090 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  28.9 
 
 		 1017 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 1100 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 983 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  31.32 
 
 		 1733 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 1186 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.68 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  31.75 
 
 		 943 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 1048 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1001 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 940 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  30.38 
 
 		 1066 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 1010 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 922 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 582 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.89 
 
 		 1018 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  28.46 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.58 
 
 		 1050 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  28.93 
 
 		 1042 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 1049 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 1071 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  31.33 
 
 		 1102 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.23 
 
 		 962 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 1198 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.5 
 
 		 1097 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 1025 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 1141 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  32.13 
 
 		 1036 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  28.99 
 
 		 1125 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  29.44 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 957 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  29.3 
 
 		 1017 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31 
 
 		 971 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  29.03 
 
 		 1021 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  26.56 
 
 		 995 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  31.22 
 
 		 1092 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  28.73 
 
 		 1699 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  29.48 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 931 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  30.5 
 
 		 1055 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 963 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 928 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.44 
 
 		 907 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 941 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  27.02 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.06 
 
 		 1056 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29 
 
 		 1022 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.18 
 
 		 919 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 1058 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  27.06 
 
 		 981 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 952 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 1088 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 423 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  31.45 
 
 		 1163 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  31.09 
 
 		 969 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  29.92 
 
 		 1033 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  26.74 
 
 		 1014 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 		 994 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  26.32 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  26.49 
 
 		 1013 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  32.77 
 
 		 926 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  32.23 
 
 		 1110 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  32.88 
 
 		 1060 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 965 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 1064 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 		 1025 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>