44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05450 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  100 
 
 		 907 aa  1853    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 867 aa  161  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.41 
 
 		 831 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  29.63 
 
 		 1083 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.92 
 
 		 1163 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  24.8 
 
 		 1204 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1116 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.47 
 
 		 999 aa  66.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.56 
 
 		 1095 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  24.5 
 
 		 1082 aa  62.4  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27 
 
 		 1108 aa  62  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  26.67 
 
 		 1094 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  26.19 
 
 		 1109 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  24.9 
 
 		 661 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.63 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  27.63 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 1193 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  27.87 
 
 		 1070 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  24.63 
 
 		 1145 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 968 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  27.88 
 
 		 1139 aa  53.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  31.13 
 
 		 1143 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  22.26 
 
 		 561 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.13 
 
 		 1061 aa  51.2  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  24.18 
 
 		 1055 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  25.86 
 
 		 1097 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 343 aa  48.9  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 212 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  30.63 
 
 		 428 aa  48.5  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  27.88 
 
 		 215 aa  48.9  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.25 
 
 		 1013 aa  48.5  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.94 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  33.33 
 
 		 1068 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.91 
 
 		 494 aa  47.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  28.91 
 
 		 1031 aa  47.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 1018 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  23.11 
 
 		 1071 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.37 
 
 		 572 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 1050 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.36 
 
 		 312 aa  45.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  32.29 
 
 		 881 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>