More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2428 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 494 aa  985    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  43.37 
 
 		 1126 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  38.33 
 
 		 1067 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  31.61 
 
 		 1034 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 1190 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.86 
 
 		 1075 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 1193 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.48 
 
 		 1029 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.32 
 
 		 1055 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  33.41 
 
 		 1013 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.69 
 
 		 1139 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  32.41 
 
 		 1143 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  30.18 
 
 		 713 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 1089 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  30.53 
 
 		 1183 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 1064 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.02 
 
 		 1044 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 1217 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.87 
 
 		 999 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 1116 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  27.22 
 
 		 1109 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 1216 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  32.09 
 
 		 991 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  32.8 
 
 		 1204 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 775 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  28.88 
 
 		 1118 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  28.17 
 
 		 1118 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 1145 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  34.66 
 
 		 1145 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.69 
 
 		 1111 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 966 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 1015 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 992 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  31.86 
 
 		 1163 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  30.61 
 
 		 1083 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 648 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  29.01 
 
 		 1097 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 723 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  25.83 
 
 		 1056 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  29.58 
 
 		 1083 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 1118 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 983 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  32.56 
 
 		 1108 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 1148 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 954 aa  80.1  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 992 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.53 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 973 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.78 
 
 		 1797 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  31.58 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  29.36 
 
 		 647 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 900 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.95 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 		 1022 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 1403 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  27.22 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  27.04 
 
 		 1101 aa  73.6  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 636 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  27.71 
 
 		 996 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  32.98 
 
 		 999 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.8 
 
 		 1685 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 1048 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 		 967 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 1050 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.6 
 
 		 1666 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.19 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  29.13 
 
 		 1095 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 		 1094 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  31.14 
 
 		 1289 aa  70.1  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 1402 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1311 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  31.1 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.34 
 
 		 1141 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  33.51 
 
 		 937 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  23.65 
 
 		 1009 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 1398 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  29.03 
 
 		 1094 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  26.36 
 
 		 985 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.55 
 
 		 1227 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  30 
 
 		 1685 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 1192 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  27.86 
 
 		 1733 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  29.54 
 
 		 261 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 244 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  28.03 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  29.58 
 
 		 1833 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.44 
 
 		 1117 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.67 
 
 		 1739 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  28.95 
 
 		 935 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  27.25 
 
 		 965 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.81 
 
 		 2051 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.15 
 
 		 959 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>