54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5818 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 636 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 1064 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  35.39 
 
 		 1044 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 644 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  38.73 
 
 		 644 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.52 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 644 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  29.94 
 
 		 1145 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.28 
 
 		 1126 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  35.1 
 
 		 1163 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 1050 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1142 aa  58.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  37.29 
 
 		 992 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  34.33 
 
 		 1034 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.77 
 
 		 1029 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.72 
 
 		 1067 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 623 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 540 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  28.14 
 
 		 597 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.92 
 
 		 1075 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1812  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.4 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 773 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  29.65 
 
 		 991 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  34.51 
 
 		 1056 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  33.1 
 
 		 549 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 530 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 679 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 1193 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  29.37 
 
 		 1058 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  32.24 
 
 		 1055 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0345  SARP family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 837 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  25.75 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  30.34 
 
 		 713 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.41 
 
 		 999 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  31.33 
 
 		 275 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  39.47 
 
 		 978 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0817  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 		 117 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.686182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 689 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  29.2 
 
 		 1042 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.05 
 
 		 914 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 539 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  28.88 
 
 		 1004 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  32.54 
 
 		 514 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  35.64 
 
 		 985 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.06 
 
 		 661 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  29.14 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 516 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  30.56 
 
 		 1061 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 612 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>