43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5023 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 623 aa  1266    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 644 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 644 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  43.38 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 679 aa  228  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.918273 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7646  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 529 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.158995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 		 582 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 584 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3528  SARP family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 539 aa  101  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1578  SARP family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 530 aa  92  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.584481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  27.97 
 
 		 607 aa  90.9  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 584 aa  87.8  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 580 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  24.15 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3925  SARP family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 597 aa  67  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 202 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  28.3 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0539  hypothetical protein  26.85 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 266 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  26.95 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 494 aa  51.2  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  32.64 
 
 		 911 aa  49.7  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.62 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  31.41 
 
 		 1056 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  26.5 
 
 		 522 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  32 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  26.95 
 
 		 531 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 636 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 773 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 1064 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.76 
 
 		 1163 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  32.65 
 
 		 650 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  25.52 
 
 		 508 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.93 
 
 		 631 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  25.52 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  26.83 
 
 		 619 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  26.94 
 
 		 641 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 		 664 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 927 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.37 
 
 		 373 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>