210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4216 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  100 
 
 
607 aa  1241    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  50.86 
 
 
594 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 
597 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.29 
 
 
598 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.62 
 
 
595 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.83 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.1 
 
 
568 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.47 
 
 
588 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.12 
 
 
622 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.71 
 
 
631 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
642 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.43 
 
 
723 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.63 
 
 
634 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.7 
 
 
624 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.38 
 
 
596 aa  171  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.81 
 
 
622 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0539  hypothetical protein  36.92 
 
 
287 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221333  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.27 
 
 
738 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.77 
 
 
643 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  28.03 
 
 
531 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  24.84 
 
 
647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  23.84 
 
 
647 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 
626 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  25.21 
 
 
603 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  29.87 
 
 
518 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  24.78 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.06 
 
 
629 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  24.75 
 
 
522 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  24.77 
 
 
652 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  29.32 
 
 
525 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  27.11 
 
 
499 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  27.8 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.29 
 
 
648 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  27.4 
 
 
502 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 
667 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.56 
 
 
658 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.21 
 
 
664 aa  103  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  27.18 
 
 
502 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  23.92 
 
 
521 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  27.45 
 
 
644 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  27.05 
 
 
508 aa  97.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  27.29 
 
 
404 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  24.63 
 
 
644 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  26.77 
 
 
644 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  23.44 
 
 
521 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  26.63 
 
 
522 aa  95.5  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 
647 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.51 
 
 
798 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  23.9 
 
 
515 aa  87  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  23.35 
 
 
543 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  24.68 
 
 
784 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  31.14 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.26 
 
 
736 aa  84  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  28.07 
 
 
623 aa  84  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
304 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  26.74 
 
 
686 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  25.18 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  30.26 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 
310 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 
312 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.84 
 
 
769 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 
582 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.29 
 
 
746 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
306 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  24.59 
 
 
636 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  25.09 
 
 
605 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
306 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.64 
 
 
315 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  31.75 
 
 
408 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  32.09 
 
 
646 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
584 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  26.24 
 
 
327 aa  66.6  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
580 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  24.33 
 
 
527 aa  65.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  23.4 
 
 
606 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 
821 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
1392 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.53 
 
 
757 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
279 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
279 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
150 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 
315 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 
295 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  24.76 
 
 
600 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  22.87 
 
 
375 aa  62.4  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
271 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
594 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
271 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  32.88 
 
 
279 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
271 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.24 
 
 
1056 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  35.92 
 
 
435 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 
680 aa  60.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  23.72 
 
 
641 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
275 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  28.57 
 
 
608 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  21.65 
 
 
650 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>