More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3831 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
643 aa  1290    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.63 
 
 
631 aa  321  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.13 
 
 
588 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.07 
 
 
598 aa  308  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.31 
 
 
595 aa  301  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.48 
 
 
624 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.75 
 
 
738 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  34.6 
 
 
603 aa  286  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.5 
 
 
622 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.2 
 
 
629 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33 
 
 
634 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.55 
 
 
568 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
626 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.12 
 
 
568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.12 
 
 
723 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  30.13 
 
 
581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
648 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 
647 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  37.16 
 
 
642 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.24 
 
 
647 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  30.93 
 
 
652 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  29.49 
 
 
647 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.29 
 
 
596 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.85 
 
 
658 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
667 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
597 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  36.68 
 
 
499 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  35.93 
 
 
502 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  34.49 
 
 
522 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  34.57 
 
 
531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  37.19 
 
 
502 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.1 
 
 
622 aa  193  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
664 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  34.23 
 
 
784 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  33.51 
 
 
543 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  27.35 
 
 
594 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  34.13 
 
 
525 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  26.64 
 
 
607 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.49 
 
 
757 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  41.33 
 
 
686 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.88 
 
 
736 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  30.81 
 
 
408 aa  157  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  34.55 
 
 
518 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  31.22 
 
 
508 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
644 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  31.7 
 
 
605 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  44.51 
 
 
327 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.57 
 
 
822 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.09 
 
 
746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  32.17 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  45.81 
 
 
304 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.53 
 
 
769 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
821 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  43.55 
 
 
317 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  31.5 
 
 
515 aa  125  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
310 aa  123  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.3 
 
 
636 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  36.36 
 
 
646 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  43.08 
 
 
553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  26.78 
 
 
527 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  29.41 
 
 
600 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  45.81 
 
 
306 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  27.57 
 
 
605 aa  117  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  40.35 
 
 
312 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.11 
 
 
737 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  37.75 
 
 
608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  41.67 
 
 
150 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  27.48 
 
 
606 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  27.15 
 
 
603 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  27.59 
 
 
479 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  27.42 
 
 
521 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  28.18 
 
 
531 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
798 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  25.97 
 
 
522 aa  100  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
580 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  25.49 
 
 
375 aa  96.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
584 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  29.02 
 
 
521 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  26.68 
 
 
404 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.01 
 
 
878 aa  84  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  25.62 
 
 
584 aa  84  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 
680 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
308 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  24.61 
 
 
643 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
1139 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.8 
 
 
619 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.91 
 
 
1149 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.11 
 
 
1141 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 
304 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  25.79 
 
 
425 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  31.98 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.47 
 
 
878 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>