195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1960 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 317 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  62.62 
 
 		 304 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  62.42 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  43.16 
 
 		 327 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50.6 
 
 		 631 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.16 
 
 		 622 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  48.52 
 
 		 622 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  49.13 
 
 		 595 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  49.4 
 
 		 738 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  43.88 
 
 		 664 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.32 
 
 		 598 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  45.86 
 
 		 667 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  53.8 
 
 		 647 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  47 
 
 		 642 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  50.31 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  45.66 
 
 		 723 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  50.28 
 
 		 647 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  45.22 
 
 		 581 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  41.5 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  41.62 
 
 		 603 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.82 
 
 		 634 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  48.3 
 
 		 647 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  45.88 
 
 		 648 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 626 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.62 
 
 		 629 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  46.78 
 
 		 652 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.76 
 
 		 588 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.61 
 
 		 624 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  47.2 
 
 		 658 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.55 
 
 		 643 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  40.48 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  41.57 
 
 		 597 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.41 
 
 		 568 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.77 
 
 		 568 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.62 
 
 		 596 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  37.65 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  47.29 
 
 		 150 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  32.53 
 
 		 594 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  31.14 
 
 		 607 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  33.16 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  39.82 
 
 		 680 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  34.71 
 
 		 1358 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 		 1094 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 536 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 		 1142 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 1198 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 612 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 		 1392 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 665 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  37.37 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  35.61 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.32 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 1037 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 633 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  39.09 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.11 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  31.13 
 
 		 1134 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.48 
 
 		 1087 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.85 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 1027 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 1027 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 1027 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  32.3 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.35 
 
 		 1093 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 532 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 		 526 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 		 662 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 741 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 		 483 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  35.05 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 		 435 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 		 468 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 864 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  34.31 
 
 		 468 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 1227 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  30.71 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  28.79 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.65 
 
 		 614 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  31.03 
 
 		 717 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 		 1065 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  31.58 
 
 		 462 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>