More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2492 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  100 
 
 		 313 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  59.87 
 
 		 310 aa  361  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  41.31 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  40.66 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  40.4 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  40.19 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  41.33 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  37.54 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.8 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  28.23 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  31.8 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  30.67 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 1392 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 468 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.16 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.11 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.53 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  34.25 
 
 		 684 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 612 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 859 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 		 858 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 		 1139 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  27.51 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 		 1093 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.12 
 
 		 725 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.4 
 
 		 1226 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.61 
 
 		 643 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.11 
 
 		 1149 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 		 1285 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  30.95 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.47 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 		 1094 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 1204 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  26.52 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  28.57 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.34 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  27.6 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.89 
 
 		 1190 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  31.52 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 		 1160 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  27.13 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  28.98 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  26.23 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.03 
 
 		 584 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  21.77 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 		 1148 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  29.76 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  26.04 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.28 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  33.61 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 		 1096 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 		 864 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  37.93 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 		 1151 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 		 1151 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  25.32 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  27.37 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 		 740 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  33.61 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 		 1142 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.1 
 
 		 622 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 		 861 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.42 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.42 
 
 		 1089 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0397  putative adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850504  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>