More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2563 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  59.87 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  38.56 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  39.07 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  39.93 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  37.46 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  27.66 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.97 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.87 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  30.03 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 		 612 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  26.67 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 		 859 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 		 858 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.88 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  28.05 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 		 468 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.41 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 481 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 1096 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.27 
 
 		 1226 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 		 1094 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 1142 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 1392 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.49 
 
 		 797 aa  63.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 		 860 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 		 1093 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  32.24 
 
 		 684 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.35 
 
 		 737 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.72 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  31.91 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.57 
 
 		 575 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.34 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  24.32 
 
 		 614 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  27.23 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 647 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.46 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28.21 
 
 		 518 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.68 
 
 		 701 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.37 
 
 		 696 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 536 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  24.58 
 
 		 741 aa  59.3  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  24.19 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.93 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  22.11 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  27.57 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.14 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.16 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  26.49 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  28.36 
 
 		 734 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  28.27 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  33.14 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 		 1285 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  25.95 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 		 561 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 597 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0397  putative adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850504  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.35 
 
 		 1190 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 		 1139 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 		 1160 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 1130 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 		 575 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  28.47 
 
 		 553 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 1204 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 652 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  33.06 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  26.06 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>