224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4144 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  32.99 
 
 
294 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  34.11 
 
 
290 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
306 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 
320 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.82 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  32.3 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  29.96 
 
 
327 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  35.93 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.67 
 
 
313 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  26.73 
 
 
308 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 
315 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 
304 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  26 
 
 
294 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1392 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
468 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
680 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 
481 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
449 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
449 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
449 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  38.38 
 
 
142 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
1142 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 
1093 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.68 
 
 
1160 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
468 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
612 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.81 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
633 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
1094 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.01 
 
 
1020 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
532 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.79 
 
 
631 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  29.94 
 
 
971 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.82 
 
 
568 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 
357 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  27.63 
 
 
1141 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.06 
 
 
568 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 
859 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 
471 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 
858 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0223  hypothetical protein  34.67 
 
 
166 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
421 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  29.01 
 
 
462 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.15 
 
 
643 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.27 
 
 
1141 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
758 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  30.43 
 
 
335 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
270 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.36 
 
 
981 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
641 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
1139 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  61.7 
 
 
121 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  36.99 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.28 
 
 
1087 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  61.7 
 
 
121 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.2 
 
 
1081 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  40.58 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 
1046 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.03 
 
 
1089 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.47 
 
 
629 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
1138 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
1148 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
1151 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  36.84 
 
 
553 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  40.28 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 
411 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.37 
 
 
1358 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 
1151 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  47.92 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30 
 
 
595 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.12 
 
 
596 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  25.39 
 
 
2132 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  30.34 
 
 
400 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  48.94 
 
 
241 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  59.57 
 
 
121 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 
1063 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.53 
 
 
1080 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>