More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4808 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  93.59 
 
 		 468 aa  898    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 468 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  58.97 
 
 		 472 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  59.31 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  56.24 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 633 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  30.24 
 
 		 612 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  44.85 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.29 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 		 1392 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  36.55 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  38.73 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  27.43 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0776  hypothetical protein  26.01 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.5 
 
 		 696 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  31.18 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.84 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 		 1148 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.65 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  32.09 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  34.67 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 		 1105 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 		 1180 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 1151 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 1151 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.59 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 		 858 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.45 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 		 643 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.48 
 
 		 1141 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.67 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 		 1156 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 1139 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 		 859 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 		 279 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.35 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.26 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.61 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 		 1172 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  27.42 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 1138 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  32.19 
 
 		 1134 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 903 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  30.07 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.34 
 
 		 638 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  31.87 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.77 
 
 		 1087 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.56 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  28.48 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  36.3 
 
 		 1209 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.25 
 
 		 701 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.32 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.33 
 
 		 670 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.73 
 
 		 1149 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.2 
 
 		 861 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 		 275 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 1160 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.66 
 
 		 1089 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 		 1142 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>