More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1307 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
320 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  92.83 
 
 
306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.1 
 
 
289 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
302 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  33.92 
 
 
299 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  40.13 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  29.47 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.51 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
315 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  29.76 
 
 
294 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 
304 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
310 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
308 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  42.76 
 
 
633 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  26.57 
 
 
308 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.5 
 
 
354 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  26.62 
 
 
327 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  35.97 
 
 
411 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  35.51 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  43.28 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 
1392 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  29.26 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  35.77 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  40.56 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  39.57 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  35.61 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  34.19 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  34.06 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  31.85 
 
 
594 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  37.96 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 
626 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.3 
 
 
588 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  28.11 
 
 
607 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
680 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.78 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  37.2 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  37.12 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.25 
 
 
643 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  31.06 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
304 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
1148 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  30.43 
 
 
379 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.09 
 
 
723 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.57 
 
 
1141 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  28.67 
 
 
400 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.51 
 
 
797 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
597 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  28.68 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.22 
 
 
738 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
1138 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
647 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0223  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  34.51 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
1151 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
1151 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
271 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 
273 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
317 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.23 
 
 
624 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 
345 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.33 
 
 
1344 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.72 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  30.57 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
1139 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
629 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.5 
 
 
632 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.58 
 
 
634 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.24 
 
 
596 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
1180 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
701 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 
642 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>