More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2656 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  66.29 
 
 
622 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  53.23 
 
 
624 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
634 aa  1294    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  66.61 
 
 
622 aa  827    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.41 
 
 
598 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.19 
 
 
595 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.13 
 
 
588 aa  369  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.82 
 
 
631 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.41 
 
 
723 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  41.74 
 
 
626 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.04 
 
 
738 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.02 
 
 
736 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  38.54 
 
 
642 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.52 
 
 
568 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.56 
 
 
568 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  38.21 
 
 
647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 
647 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 
647 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  37.66 
 
 
652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  36.35 
 
 
603 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.18 
 
 
629 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33 
 
 
643 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  34.24 
 
 
581 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.32 
 
 
757 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.43 
 
 
746 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
597 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.02 
 
 
596 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  42.12 
 
 
531 aa  210  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  38.51 
 
 
522 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 
594 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
821 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  46.88 
 
 
502 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.87 
 
 
798 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  32.75 
 
 
784 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  42.41 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  36.13 
 
 
499 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  54.86 
 
 
648 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  33.33 
 
 
525 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.31 
 
 
769 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  26.41 
 
 
607 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  34.91 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  52.66 
 
 
667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  51.65 
 
 
312 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  48.96 
 
 
664 aa  170  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  53.53 
 
 
658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  31.43 
 
 
686 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  48.82 
 
 
317 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
644 aa  151  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  34.26 
 
 
605 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  49.11 
 
 
304 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  42.27 
 
 
543 aa  147  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  53.52 
 
 
150 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  42.61 
 
 
310 aa  144  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  46.02 
 
 
553 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  30.99 
 
 
510 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  43.59 
 
 
646 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.39 
 
 
737 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  45.29 
 
 
408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  39.23 
 
 
327 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.71 
 
 
822 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  46.75 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  28.53 
 
 
508 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 
636 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  35.29 
 
 
608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  29.18 
 
 
515 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  27.3 
 
 
606 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 
582 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  30.25 
 
 
425 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
580 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 
375 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
584 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.27 
 
 
619 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  27.67 
 
 
522 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
878 aa  97.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  27.12 
 
 
605 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  29.94 
 
 
531 aa  95.1  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  24.36 
 
 
600 aa  93.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26.32 
 
 
521 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  26.03 
 
 
603 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  25.61 
 
 
527 aa  90.1  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.57 
 
 
1023 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 
878 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.56 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  26.39 
 
 
479 aa  84  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  25.38 
 
 
404 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
878 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 
810 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 
836 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
685 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
632 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.27 
 
 
1007 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 
279 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.06 
 
 
745 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 
1037 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>