77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0259 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  100 
 
 
327 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  29.96 
 
 
299 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  27.71 
 
 
290 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
320 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  26.24 
 
 
306 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.63 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  22.91 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  27.41 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  24.54 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  37.63 
 
 
142 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  41.11 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  26.27 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  26.24 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  23.13 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  27.13 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  42.86 
 
 
221 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  41.89 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  22.71 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0223  hypothetical protein  25.23 
 
 
166 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  35.53 
 
 
694 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  32.29 
 
 
122 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  31.25 
 
 
122 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  23.97 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 
219 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  32.93 
 
 
141 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0909  FHA domain-containing protein  40.3 
 
 
120 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
848 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  37.88 
 
 
238 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1070  FHA domain containing protein  39.13 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.76 
 
 
451 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  37.14 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.8 
 
 
851 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  23.86 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  32.05 
 
 
147 aa  46.2  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  31.87 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  34.69 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00240  FHA domain-containing protein  34.04 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  40.54 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0176  FHA domain containing protein  34.44 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.74043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  36.36 
 
 
508 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0878  Forkhead-associated protein  40.43 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  37.23 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0553  FHA domain-containing protein  40.85 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.23 
 
 
1004 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  24.77 
 
 
673 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  34.48 
 
 
162 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  36.36 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 
242 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  36.46 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
157 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
183 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  31.87 
 
 
150 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  31.87 
 
 
150 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  41.67 
 
 
433 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.82 
 
 
799 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.3 
 
 
554 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  36.84 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1317  Forkhead-associated protein  32.05 
 
 
168 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  44.44 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.3 
 
 
802 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  36.49 
 
 
153 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.51 
 
 
557 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  32.47 
 
 
228 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.78 
 
 
799 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 
796 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  31.46 
 
 
179 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2044  FHA domain-containing protein  31.48 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130358  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  36.51 
 
 
167 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>