More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0031 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0776  hypothetical protein  79.37 
 
 
441 aa  739    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
633 aa  1291    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  42.19 
 
 
612 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
468 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  29.98 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
481 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  46.7 
 
 
472 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  41.36 
 
 
471 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  42.07 
 
 
354 aa  144  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  42.13 
 
 
357 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 
306 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  42.76 
 
 
320 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 
302 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  33.1 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  39.66 
 
 
275 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  30.68 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.9 
 
 
431 aa  73.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  31.58 
 
 
294 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 
680 aa  71.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.75 
 
 
805 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.01 
 
 
701 aa  71.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
859 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
758 aa  70.5  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 
310 aa  70.1  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.69 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.56 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
1392 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.07 
 
 
701 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
263 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
858 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
645 aa  66.6  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
308 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
911 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
295 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
860 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
304 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
651 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.38 
 
 
487 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.93 
 
 
289 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
729 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
411 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.55 
 
 
737 aa  65.1  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 
735 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 
903 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
607 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
271 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
271 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
271 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 
532 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  31.43 
 
 
670 aa  62.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
746 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
611 aa  62  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
529 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  25.14 
 
 
643 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
279 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
308 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
641 aa  61.6  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
864 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
532 aa  61.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.67 
 
 
614 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
861 aa  61.2  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
337 aa  60.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 
591 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28 
 
 
518 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  26 
 
 
460 aa  60.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
279 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
279 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.99 
 
 
797 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
317 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  29.08 
 
 
299 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
526 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
261 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.38 
 
 
2132 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  26.58 
 
 
636 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.19 
 
 
1149 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 
632 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  28.71 
 
 
400 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  30.11 
 
 
1358 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
738 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
515 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.9 
 
 
1080 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.77 
 
 
585 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 
304 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.16 
 
 
672 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.53 
 
 
757 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.16 
 
 
656 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
483 aa  58.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 
284 aa  58.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.73 
 
 
643 aa  58.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.02 
 
 
465 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  24.76 
 
 
518 aa  57.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  30.46 
 
 
635 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
425 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
1142 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
597 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.78 
 
 
643 aa  57.4  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>