More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2885 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
588 aa  1201    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.75 
 
 
598 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.76 
 
 
595 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  45.32 
 
 
622 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  48.21 
 
 
622 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.89 
 
 
631 aa  359  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.26 
 
 
624 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.72 
 
 
568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.13 
 
 
634 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.18 
 
 
738 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.4 
 
 
568 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.07 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
642 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.2 
 
 
723 aa  316  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
626 aa  312  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.13 
 
 
643 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  34.29 
 
 
603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
596 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
648 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  33.23 
 
 
652 aa  296  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  31.63 
 
 
647 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  32.01 
 
 
581 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
647 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 
658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  37.79 
 
 
499 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  37.53 
 
 
502 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  29.77 
 
 
594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  37.98 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  37.06 
 
 
525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  35.62 
 
 
531 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  34.76 
 
 
522 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  30.99 
 
 
375 aa  183  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  39.8 
 
 
518 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  52.69 
 
 
647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  51.63 
 
 
664 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  33.94 
 
 
784 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  26.88 
 
 
607 aa  177  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  49.71 
 
 
312 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  34.7 
 
 
515 aa  173  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  34 
 
 
543 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  51.48 
 
 
667 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  49.36 
 
 
553 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  44.38 
 
 
310 aa  161  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  30.25 
 
 
510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.27 
 
 
736 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.58 
 
 
757 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  42.02 
 
 
304 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  38.04 
 
 
686 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  53.44 
 
 
150 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.85 
 
 
769 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  32.2 
 
 
408 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  32.36 
 
 
508 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.72 
 
 
746 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  41.76 
 
 
317 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  37.19 
 
 
605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  31.93 
 
 
646 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  40.62 
 
 
306 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.25 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  31.37 
 
 
600 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
470 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  34.86 
 
 
327 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.1 
 
 
798 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  36.9 
 
 
608 aa  124  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
644 aa  123  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  28.26 
 
 
606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  26.1 
 
 
527 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  28.67 
 
 
605 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 
582 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  26.57 
 
 
522 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  30.62 
 
 
531 aa  106  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  24.86 
 
 
521 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
584 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  25.57 
 
 
643 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 
821 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1418  hypothetical protein  25.06 
 
 
643 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.070904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.38 
 
 
737 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
580 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.85 
 
 
878 aa  97.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  27.7 
 
 
603 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  26.82 
 
 
404 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  27.33 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 
1392 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  25.91 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  25.71 
 
 
649 aa  83.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.76 
 
 
878 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.43 
 
 
822 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  25.13 
 
 
612 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 
680 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  24.25 
 
 
641 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 
271 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  23.81 
 
 
650 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3207  transcriptional regulator, SARP family  24.32 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>