More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0706 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 479 aa  973    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  31.89 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  30.9 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.62 
 
 		 629 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  28.6 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  30.98 
 
 		 502 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  29.71 
 
 		 521 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  29.82 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  27.27 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.02 
 
 		 568 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.27 
 
 		 568 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  29.22 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  28.74 
 
 		 521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.19 
 
 		 736 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.81 
 
 		 631 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 626 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.59 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  27.44 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 636 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  28.61 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  28.7 
 
 		 531 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.47 
 
 		 598 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.6 
 
 		 595 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  25.12 
 
 		 527 aa  90.1  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  25.85 
 
 		 606 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.33 
 
 		 588 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  26.39 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  26.17 
 
 		 784 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  27.25 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.39 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 821 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  22.79 
 
 		 619 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  24.32 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  26 
 
 		 600 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.85 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  28.9 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.19 
 
 		 622 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.2 
 
 		 769 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  23.23 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  22.92 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  24.36 
 
 		 603 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.83 
 
 		 624 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3284  transcriptional regulator, CadC  49.35 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.72 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  46.24 
 
 		 973 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  47.67 
 
 		 973 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 1014 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  22.76 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.735415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3081  invasion protein regulator  22.76 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  22.76 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  22.76 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  23.59 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  47.67 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  46 
 
 		 948 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  45.83 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.8 
 
 		 798 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.12 
 
 		 746 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  49.33 
 
 		 948 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.49 
 
 		 622 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  45.24 
 
 		 973 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 481 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 543 aa  67  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  26.88 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 972 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3088  transcriptional regulator, CadC  44.58 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 921 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6027  transcriptional regulator, CadC  41.33 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0284754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 927 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.32 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.74 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  44.93 
 
 		 756 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  26.4 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.68 
 
 		 822 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  40.34 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 712 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.67 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 950 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  38.04 
 
 		 711 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 878 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.42 
 
 		 738 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  26.6 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 591 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  41.49 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26.28 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  30.16 
 
 		 608 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>