More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5608 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 
521 aa  1041    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  74.04 
 
 
521 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  53.47 
 
 
522 aa  532  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  36.6 
 
 
531 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  35.83 
 
 
522 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  32.63 
 
 
525 aa  220  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  30.75 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  30.33 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
626 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  30.36 
 
 
531 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  25.74 
 
 
425 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  28.38 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  27.46 
 
 
502 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  29.82 
 
 
543 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.57 
 
 
595 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  28.64 
 
 
502 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  28.57 
 
 
515 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  28.99 
 
 
479 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.04 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.81 
 
 
598 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  27.89 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.87 
 
 
568 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
647 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 
647 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  50.81 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  50.81 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  50.81 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.34 
 
 
736 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.97 
 
 
643 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.6 
 
 
619 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  25.89 
 
 
647 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  25.98 
 
 
508 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31 
 
 
629 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  32.3 
 
 
603 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  46.77 
 
 
409 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.25 
 
 
568 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  50 
 
 
436 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  28.99 
 
 
636 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.87 
 
 
746 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  25.72 
 
 
607 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  29.54 
 
 
784 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
582 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 
588 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 
658 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
580 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 
652 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
597 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  26.23 
 
 
686 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
584 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.84 
 
 
648 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.39 
 
 
596 aa  94.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.39 
 
 
738 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.63 
 
 
634 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.62 
 
 
622 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  25.71 
 
 
642 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.95 
 
 
624 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  29.34 
 
 
581 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 
664 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.22 
 
 
622 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.41 
 
 
798 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  26.18 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.72 
 
 
769 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 
594 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  44.55 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.35 
 
 
757 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 
821 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.54 
 
 
737 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
644 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  26.54 
 
 
612 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  25.48 
 
 
649 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.47 
 
 
723 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  22.41 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  40.48 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  39.6 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4743  transcriptional regulator, CadC  32.67 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.274982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3207  transcriptional regulator, SARP family  25.14 
 
 
615 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  21.88 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.735415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  42.72 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3081  invasion protein regulator  21.88 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  21.88 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  21.88 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  21.88 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  31 
 
 
678 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  34.65 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  33 
 
 
712 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  32.61 
 
 
972 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2919  transcriptional regulatory protein-like protein  28.79 
 
 
604 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  27.2 
 
 
605 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  27.83 
 
 
650 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.27 
 
 
822 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  25.22 
 
 
605 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  27.81 
 
 
641 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  23.17 
 
 
600 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.3 
 
 
323 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  23.46 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0701  transcriptional regulator, CadC  33.7 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  32.29 
 
 
234 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  34.38 
 
 
234 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>