More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3669 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  100 
 
 
527 aa  1065    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  29.89 
 
 
518 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  27.48 
 
 
522 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  29.82 
 
 
521 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  30.05 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  27.44 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  30.55 
 
 
525 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  30.33 
 
 
521 aa  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  27.44 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.89 
 
 
598 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  25.2 
 
 
499 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  27.14 
 
 
603 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.1 
 
 
588 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.78 
 
 
643 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  27.24 
 
 
510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.11 
 
 
595 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.82 
 
 
631 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  28.13 
 
 
581 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  25.1 
 
 
531 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  24.73 
 
 
425 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.29 
 
 
596 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.6 
 
 
723 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  24.09 
 
 
502 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  24.46 
 
 
543 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  24.24 
 
 
502 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 
647 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  25 
 
 
515 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  26.87 
 
 
642 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.75 
 
 
738 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.96 
 
 
624 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  25.88 
 
 
784 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.98 
 
 
622 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.27 
 
 
568 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 
648 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.35 
 
 
634 aa  90.5  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 
647 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.5 
 
 
736 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.27 
 
 
568 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  25.12 
 
 
479 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 
652 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
664 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.58 
 
 
622 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  36.89 
 
 
413 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.89 
 
 
413 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  36.89 
 
 
413 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  24.88 
 
 
594 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  40 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  22.99 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 
582 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.43 
 
 
658 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  24.94 
 
 
600 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  36.84 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.67 
 
 
629 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4743  transcriptional regulator, CadC  34.71 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.274982 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  26.8 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
580 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.55 
 
 
769 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  25.36 
 
 
647 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
584 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.2 
 
 
746 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 
375 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  25.19 
 
 
606 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 
667 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.25 
 
 
798 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.6 
 
 
757 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  40.43 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
927 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.57 
 
 
560 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
3560 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
3035 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  26.23 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3088  transcriptional regulator, CadC  35.64 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  27.45 
 
 
711 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  24.15 
 
 
580 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  24.62 
 
 
1080 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  28.29 
 
 
649 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  25.95 
 
 
1075 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
279 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  34.34 
 
 
762 aa  64.3  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.95 
 
 
1075 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3795  transcriptional regulator, CadC  31.91 
 
 
325 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.95 
 
 
1063 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  24.65 
 
 
636 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  22.18 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3081  invasion protein regulator  22.18 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  22.18 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
713 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  22.18 
 
 
555 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.735415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  24.33 
 
 
607 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  22.18 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 
715 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
1276 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
644 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  33.33 
 
 
1020 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  24.57 
 
 
603 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.94 
 
 
267 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
1094 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>