192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6036 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 650 aa  1316    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  92.38 
 
 		 641 aa  1205    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 612 aa  199  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  28.55 
 
 		 649 aa  190  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3207  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 		 615 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  31.35 
 
 		 643 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1418  hypothetical protein  26.56 
 
 		 643 aa  177  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.070904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.01 
 
 		 596 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  25.73 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  26.85 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  28.1 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.54 
 
 		 631 aa  80.9  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.19 
 
 		 568 aa  80.9  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.71 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.47 
 
 		 598 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.31 
 
 		 595 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.45 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.81 
 
 		 588 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  25.06 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.78 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.08 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  31.78 
 
 		 1139 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  25.23 
 
 		 652 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 878 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.65 
 
 		 1163 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  33.93 
 
 		 1097 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  23.46 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  23.9 
 
 		 605 aa  62  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  21.67 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.74 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  23.94 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.1 
 
 		 810 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 911 aa  60.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  30.87 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  27.12 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  22.83 
 
 		 603 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.75 
 
 		 1204 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  21.17 
 
 		 607 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 808 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.72 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  22.25 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.27 
 
 		 1163 aa  57.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.33 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.72 
 
 		 1034 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 1737 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  22.41 
 
 		 594 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  26.58 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.37 
 
 		 648 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  35.9 
 
 		 494 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 3145 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 1050 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  20.97 
 
 		 375 aa  53.9  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  26.64 
 
 		 1145 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.76 
 
 		 798 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4194  SARP family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.03 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 212 aa  53.9  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.48 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.11 
 
 		 1145 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 470 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 		 626 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.86 
 
 		 634 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  31.45 
 
 		 521 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  43.4 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 208 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 584 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 667 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  22.79 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.54 
 
 		 863 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  24.17 
 
 		 602 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.29 
 
 		 707 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.43 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 209 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  30.13 
 
 		 261 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 697 aa  51.2  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 1089 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  37.5 
 
 		 1108 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 615 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 626 aa  50.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  21.65 
 
 		 647 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.43 
 
 		 1126 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.87 
 
 		 780 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>