More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0534 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  65.94 
 
 		 647 aa  848    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  62.05 
 
 		 648 aa  775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  69.66 
 
 		 647 aa  929    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  68.44 
 
 		 647 aa  890    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  64.48 
 
 		 652 aa  783    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 642 aa  1292    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  60 
 
 		 658 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  43.16 
 
 		 667 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  45.33 
 
 		 664 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.05 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.69 
 
 		 595 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.81 
 
 		 598 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.21 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.37 
 
 		 634 aa  319  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  39.01 
 
 		 624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.73 
 
 		 568 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.38 
 
 		 723 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.11 
 
 		 568 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 626 aa  293  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.1 
 
 		 738 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  31.46 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.84 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.28 
 
 		 622 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  37.94 
 
 		 408 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.44 
 
 		 643 aa  233  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  28.53 
 
 		 581 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.98 
 
 		 596 aa  228  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  34.89 
 
 		 522 aa  191  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  67.18 
 
 		 150 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  26.91 
 
 		 594 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  55.23 
 
 		 622 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  33.33 
 
 		 531 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  35.13 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  25.16 
 
 		 607 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  34.27 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  34.1 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  33.92 
 
 		 499 aa  167  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  57.49 
 
 		 553 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  50.3 
 
 		 312 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 		 310 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 580 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.78 
 
 		 798 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  47 
 
 		 317 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  28.81 
 
 		 508 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  45.99 
 
 		 304 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 584 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 582 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  29.49 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  31.35 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  37.24 
 
 		 327 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  47.47 
 
 		 306 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.25 
 
 		 769 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  30.27 
 
 		 404 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.06 
 
 		 736 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 821 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  29.39 
 
 		 522 aa  112  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.9 
 
 		 757 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  27.21 
 
 		 527 aa  109  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  33.97 
 
 		 543 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.57 
 
 		 746 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 644 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  28.31 
 
 		 521 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  26.92 
 
 		 784 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  27.17 
 
 		 686 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  33.68 
 
 		 608 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  34.06 
 
 		 646 aa  91.3  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 		 449 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 		 449 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 		 449 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.4 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  23.54 
 
 		 606 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.46 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 1392 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  24.89 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.81 
 
 		 878 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 279 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  26.63 
 
 		 531 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  34.57 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 		 1037 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  26.39 
 
 		 605 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  39.31 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  23.1 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.66 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 		 275 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.23 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>