112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5105 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  60.27 
 
 
606 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  63.26 
 
 
605 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  60.7 
 
 
600 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1221    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  39.34 
 
 
584 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  35.64 
 
 
596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  34.91 
 
 
602 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  35.31 
 
 
318 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.01 
 
 
631 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.54 
 
 
596 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  27.58 
 
 
569 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.06 
 
 
738 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  28.28 
 
 
605 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.15 
 
 
643 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  27.12 
 
 
502 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  27 
 
 
502 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.79 
 
 
568 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  27.54 
 
 
499 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  27.32 
 
 
518 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  28.84 
 
 
784 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.54 
 
 
598 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.81 
 
 
595 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.75 
 
 
568 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.8 
 
 
746 aa  97.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.7 
 
 
588 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  43.81 
 
 
368 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.57 
 
 
624 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27 
 
 
629 aa  92  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.03 
 
 
634 aa  92  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
644 aa  91.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  25.9 
 
 
595 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 
219 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  29.19 
 
 
525 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
626 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  25.47 
 
 
522 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  26.52 
 
 
636 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  40.52 
 
 
188 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 
239 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.28 
 
 
736 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  25.06 
 
 
603 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  42.2 
 
 
191 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  47.73 
 
 
274 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25 
 
 
622 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  26.76 
 
 
531 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  25.18 
 
 
607 aa  77  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.91 
 
 
757 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
597 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  32.95 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  24.36 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  31.21 
 
 
686 aa  75.1  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  30.97 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  25.16 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 
375 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  40.95 
 
 
594 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.32 
 
 
622 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  23.47 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  28.49 
 
 
646 aa  70.5  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.3 
 
 
723 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  23.99 
 
 
581 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  24.72 
 
 
594 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  24.76 
 
 
619 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  23.45 
 
 
510 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  24.28 
 
 
641 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  26.91 
 
 
531 aa  64.3  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  30.71 
 
 
414 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  24.57 
 
 
527 aa  62.4  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.76 
 
 
648 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.64 
 
 
647 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.69 
 
 
798 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  27.92 
 
 
647 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
769 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
386 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  23.36 
 
 
650 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 
642 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  31 
 
 
647 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
652 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  24.87 
 
 
581 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 
658 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  24.61 
 
 
404 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
878 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  23.06 
 
 
667 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
1737 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
593 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  21.82 
 
 
522 aa  50.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  20.55 
 
 
584 aa  50.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 
810 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  26.61 
 
 
521 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
621 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 
581 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  23.72 
 
 
314 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 
632 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
366 aa  47.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.95 
 
 
689 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.12 
 
 
1056 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 
190 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  22.15 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.53 
 
 
676 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>