More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2284 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  56.03 
 
 		 315 aa  332  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  52.7 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  48.84 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  48.16 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  40.66 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  38.08 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  38.69 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.75 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  28.66 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  27.21 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.54 
 
 		 723 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.74 
 
 		 1392 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  25.63 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.62 
 
 		 622 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.62 
 
 		 622 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.73 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.56 
 
 		 631 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  27.78 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.18 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.88 
 
 		 658 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  45.36 
 
 		 667 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  37.7 
 
 		 652 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  36 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  24.54 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  39.37 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  33.86 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.91 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.42 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  28.82 
 
 		 680 aa  69.3  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.75 
 
 		 629 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  39.58 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 1130 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.1 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.5 
 
 		 598 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.75 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 		 1133 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 		 633 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  29.59 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  40.35 
 
 		 664 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 		 1094 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 1138 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 		 1142 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 		 642 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  32.47 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.91 
 
 		 634 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 		 1139 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.79 
 
 		 596 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 647 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.79 
 
 		 648 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  35.17 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  28.35 
 
 		 594 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  28.35 
 
 		 607 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  26.54 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.86 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.34 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.19 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  36.9 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.86 
 
 		 1226 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 		 199 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 		 1151 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  28.27 
 
 		 717 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 		 1151 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  33.88 
 
 		 404 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 		 1148 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 		 1093 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  33.08 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  24.18 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.82 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 626 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.56 
 
 		 725 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  25.68 
 
 		 701 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  23.63 
 
 		 515 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>