272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1383 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  100 
 
 
603 aa  1237    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  67.99 
 
 
581 aa  834    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 
626 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.29 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.22 
 
 
595 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.21 
 
 
622 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.35 
 
 
634 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  36.55 
 
 
624 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.67 
 
 
622 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.07 
 
 
643 aa  286  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.07 
 
 
631 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.44 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.67 
 
 
738 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.72 
 
 
568 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.44 
 
 
723 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.4 
 
 
568 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 
642 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
647 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 
647 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
597 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
647 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.92 
 
 
648 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
658 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  29.83 
 
 
652 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.95 
 
 
629 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.38 
 
 
596 aa  203  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  31.18 
 
 
522 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  30.73 
 
 
531 aa  171  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  44.02 
 
 
304 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  33.84 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  26.25 
 
 
594 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  25.04 
 
 
607 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  30.89 
 
 
502 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  29.93 
 
 
518 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  41.62 
 
 
317 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  30.18 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  46.25 
 
 
306 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  44.77 
 
 
664 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  41.67 
 
 
310 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  42.42 
 
 
312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  30 
 
 
784 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  30.69 
 
 
525 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  42.77 
 
 
667 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.12 
 
 
757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
327 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.62 
 
 
746 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  28.08 
 
 
408 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.27 
 
 
736 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  27.14 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  38.1 
 
 
553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  27.16 
 
 
508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  30.45 
 
 
510 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  42.96 
 
 
150 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  28.54 
 
 
531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  35.92 
 
 
543 aa  112  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
644 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  27.55 
 
 
375 aa  104  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  30.14 
 
 
515 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  35.38 
 
 
646 aa  101  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  29.59 
 
 
521 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
580 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  28.65 
 
 
686 aa  98.2  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
584 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
821 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 
582 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  25.84 
 
 
605 aa  94  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.43 
 
 
769 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.7 
 
 
798 aa  90.9  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  32.3 
 
 
521 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  28.97 
 
 
522 aa  88.6  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  32.37 
 
 
608 aa  87.4  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.1 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  25.06 
 
 
603 aa  85.1  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  29.26 
 
 
636 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  24.08 
 
 
600 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.75 
 
 
822 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  26.16 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  38.76 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  25.12 
 
 
606 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  26.05 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 
680 aa  73.9  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
1392 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  23.75 
 
 
404 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.7 
 
 
878 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 
878 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 
308 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 
275 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  24.54 
 
 
602 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.87 
 
 
289 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.89 
 
 
513 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.99 
 
 
354 aa  60.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 
471 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 
468 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 
468 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 
357 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
329 aa  58.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>