55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4047 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1213    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  48.81 
 
 		 596 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 584 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  35.45 
 
 		 606 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  36.61 
 
 		 600 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  35.92 
 
 		 605 aa  299  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  34.3 
 
 		 603 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  41.08 
 
 		 318 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 616 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  27.37 
 
 		 569 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  45.6 
 
 		 239 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  45.65 
 
 		 274 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  37.9 
 
 		 368 aa  90.9  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  44.76 
 
 		 191 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  43.41 
 
 		 219 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  44.55 
 
 		 188 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  34.62 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  25.46 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  35.24 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  24.42 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  24.69 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.05 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 636 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  24.42 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 597 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  24.35 
 
 		 641 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  27.17 
 
 		 784 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  23.59 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.56 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.53 
 
 		 598 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 626 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  24.78 
 
 		 650 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  24.43 
 
 		 605 aa  54.7  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.87 
 
 		 629 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  22.9 
 
 		 527 aa  51.6  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  32.29 
 
 		 581 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.05 
 
 		 631 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.55 
 
 		 568 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.47 
 
 		 757 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  22.76 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.97 
 
 		 595 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.86 
 
 		 622 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  27.42 
 
 		 510 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.88 
 
 		 769 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.6 
 
 		 723 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  24.44 
 
 		 508 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  27.57 
 
 		 608 aa  44.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.17 
 
 		 588 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  22.07 
 
 		 821 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>