22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5936 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  67.5 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  52.47 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  57.23 
 
 		 188 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  55.24 
 
 		 616 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  42.77 
 
 		 602 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  52.48 
 
 		 375 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  41.09 
 
 		 596 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  49.06 
 
 		 605 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  41.75 
 
 		 368 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  46.85 
 
 		 603 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  51.49 
 
 		 386 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  50.57 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  41.28 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  45.79 
 
 		 600 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  46.08 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  40.32 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  37.04 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  44.66 
 
 		 581 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  26.88 
 
 		 414 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  32.76 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  33.91 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>