22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1984 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  755    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  46.08 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  44.95 
 
 		 605 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  47.57 
 
 		 188 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  46.53 
 
 		 616 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  43.81 
 
 		 603 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  37.65 
 
 		 600 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  35.11 
 
 		 584 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  45.37 
 
 		 191 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  37.9 
 
 		 602 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  42.16 
 
 		 596 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  43 
 
 		 239 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  37.76 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  38.52 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  43.81 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  39 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  35.71 
 
 		 595 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  33.98 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  27.27 
 
 		 594 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  32.81 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>