23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1711 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1711  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  849    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99847  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  36.22 
 
 
606 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2298  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  40 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4047  hypothetical protein  34.62 
 
 
602 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136047  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4048  hypothetical protein  37.5 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  32.67 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4033  hypothetical protein  34.34 
 
 
596 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4455  hypothetical protein  31.4 
 
 
191 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1212  hypothetical protein  41.11 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  32.69 
 
 
600 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1984  hypothetical protein  33.98 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3240  hypothetical protein  34.15 
 
 
188 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787646  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5936  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
239 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0246268  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  31.73 
 
 
605 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0279  tetratricopeptide TPR_4  35.04 
 
 
581 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  30.36 
 
 
594 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  37.5 
 
 
603 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5239  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
219 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1109  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 
375 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1098  hypothetical protein  31 
 
 
595 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2138  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5103  hypothetical protein  24.74 
 
 
251 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.368193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>