More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2321 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  100 
 
 
568 aa  1159    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  92.08 
 
 
568 aa  1051    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  62.47 
 
 
499 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  58.2 
 
 
502 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  63.24 
 
 
502 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.97 
 
 
595 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.4 
 
 
588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.14 
 
 
598 aa  346  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.8 
 
 
738 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.16 
 
 
624 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.43 
 
 
631 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.15 
 
 
723 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.28 
 
 
634 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.54 
 
 
622 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 
648 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 
652 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.67 
 
 
622 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.31 
 
 
629 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.7 
 
 
643 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 
597 aa  279  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  31.72 
 
 
603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.07 
 
 
596 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  31.97 
 
 
581 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  34.62 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  35.48 
 
 
518 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
647 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  36.34 
 
 
531 aa  188  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  35.45 
 
 
525 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  27.62 
 
 
607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
647 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 
642 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
647 aa  177  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  27.41 
 
 
594 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 
658 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  37.69 
 
 
784 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.74 
 
 
736 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  35.93 
 
 
543 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  50.29 
 
 
310 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32 
 
 
746 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  34.25 
 
 
510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
644 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  34.05 
 
 
515 aa  146  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 
664 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  32.84 
 
 
636 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  31.25 
 
 
508 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  45.18 
 
 
667 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.36 
 
 
757 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  29 
 
 
605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  40.41 
 
 
312 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  27.8 
 
 
606 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.23 
 
 
769 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  27.18 
 
 
600 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
470 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  43.98 
 
 
553 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
798 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  50.36 
 
 
150 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  31.02 
 
 
479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  36.36 
 
 
605 aa  120  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  41.82 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  25.35 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  32.16 
 
 
686 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  42.41 
 
 
317 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  40.51 
 
 
304 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
821 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  37.64 
 
 
646 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  28.71 
 
 
531 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
582 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  27.86 
 
 
521 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  29.05 
 
 
522 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
584 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  40.49 
 
 
408 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  26.75 
 
 
603 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  41.14 
 
 
306 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  34.01 
 
 
608 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  25.3 
 
 
527 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  25.25 
 
 
641 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  28.4 
 
 
404 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.3 
 
 
822 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  28.34 
 
 
521 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  25.33 
 
 
643 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.42 
 
 
737 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  22.76 
 
 
612 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5186  hypothetical protein  25.62 
 
 
584 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510338  normal  0.40998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
878 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  25.19 
 
 
650 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  25.14 
 
 
649 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
810 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1418  hypothetical protein  24.81 
 
 
643 aa  81.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.070904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3207  transcriptional regulator, SARP family  23.63 
 
 
615 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 
1198 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  39.55 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  27.98 
 
 
460 aa  67  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  31.79 
 
 
1134 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.96 
 
 
619 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.28 
 
 
878 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 
680 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>