More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3419 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  100 
 
 
723 aa  1470    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.45 
 
 
738 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.28 
 
 
622 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.86 
 
 
631 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37 
 
 
595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.11 
 
 
622 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.01 
 
 
598 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.27 
 
 
624 aa  342  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.24 
 
 
634 aa  342  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.96 
 
 
629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37.29 
 
 
647 aa  328  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.2 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  36.38 
 
 
642 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 
648 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.15 
 
 
568 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.83 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 
652 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
647 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
647 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
658 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.12 
 
 
643 aa  281  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  33.44 
 
 
603 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  31.84 
 
 
581 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
626 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
667 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 
664 aa  249  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.81 
 
 
596 aa  242  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
597 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  36.39 
 
 
502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  34.56 
 
 
531 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  35.78 
 
 
499 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  35.51 
 
 
522 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  35.56 
 
 
502 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  35.54 
 
 
784 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  26.44 
 
 
607 aa  178  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  29.53 
 
 
408 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.9 
 
 
736 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  28.19 
 
 
594 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.97 
 
 
746 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 
769 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.33 
 
 
757 aa  157  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.54 
 
 
798 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  39.58 
 
 
304 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  46.75 
 
 
310 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  35.28 
 
 
525 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  47.95 
 
 
312 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  34.49 
 
 
644 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
821 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  45.66 
 
 
317 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  42.94 
 
 
327 aa  144  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  41.59 
 
 
518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
306 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  33.89 
 
 
510 aa  138  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  41.07 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  39.8 
 
 
543 aa  134  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  50.38 
 
 
150 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  31.29 
 
 
515 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  32.79 
 
 
605 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  29.26 
 
 
686 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  37.31 
 
 
646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.94 
 
 
822 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.55 
 
 
737 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  35.18 
 
 
608 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  28.74 
 
 
636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  27.34 
 
 
508 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  26.04 
 
 
606 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  26.86 
 
 
527 aa  107  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 
582 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  30.13 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
580 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
584 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.14 
 
 
878 aa  94  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.74 
 
 
878 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  24.51 
 
 
375 aa  92.8  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  25.28 
 
 
605 aa  92  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26.82 
 
 
521 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  24.15 
 
 
600 aa  87.8  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  26.05 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  26.46 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  36.97 
 
 
680 aa  75.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.15 
 
 
1023 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  23.57 
 
 
603 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
1142 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  31.38 
 
 
1134 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 
1094 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 
1392 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  30.02 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 
1148 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.37 
 
 
1149 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 
1151 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 
1151 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  32.48 
 
 
435 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 
1138 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4393  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.79 
 
 
1019 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.618951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>